More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1699 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1699  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 253 aa  508  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.021514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  43.95 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10850  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  42.16 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.384201  normal  0.913003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2378  alanine racemase domain protein  41.8 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42.44 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  38.58 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  38.46 
 
 		 239 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  36.73 
 
 		 231 aa  148  9e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  35.54 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  41.78 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  41.77 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  38.62 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  39.33 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  39.66 
 
 		 236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  40.76 
 
 		 228 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  40.83 
 
 		 238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  40.74 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  41.25 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  42.26 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  37.92 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  41.25 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  35.29 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  40.59 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  37.6 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  39.75 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  39.24 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  39.75 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  37.66 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  41.22 
 
 		 232 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  37.13 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  40.51 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  38.84 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  38.4 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  38.14 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  33.47 
 
 		 234 aa  135  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  37.39 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  39 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  39.64 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  35.98 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  38.82 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  40.36 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  35.15 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  34.45 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  36 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  37.5 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  37.5 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  37.5 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  37.5 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  37.5 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  37.5 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  37.5 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  35.8 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  41.7 
 
 		 228 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  36.44 
 
 		 241 aa  132  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  37.6 
 
 		 226 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  39.75 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  42.26 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  34.17 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  37.08 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08000  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.87 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0412796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  37.14 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  34.87 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  36.21 
 
 		 236 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  35.22 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  34.87 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  34.02 
 
 		 237 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  37.24 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0328  hypothetical protein  41.42 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2411  hypothetical protein  41.42 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429006  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  34.03 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3346  hypothetical protein  41.42 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2598  hypothetical protein  41.42 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.734317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1189  hypothetical protein  41.42 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  34.15 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  38.08 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  42.08 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  38.91 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  34.03 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1222  hypothetical protein  34.98 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  33.86 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  38.08 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3702  alanine racemase domain protein  36.89 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  36.29 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0088  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  35.98 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154646 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  37.66 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3299  hypothetical protein  41 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244071  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0930  alanine racemase domain protein  40.17 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246462  normal  0.758463 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3333  hypothetical protein  41 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  38.93 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  33.06 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  36.71 
 
 		 244 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  34.14 
 
 		 259 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  42.08 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>