More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1431 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  54.81 
 
 		 255 aa  208  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2378  alanine racemase domain protein  55.56 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  52.43 
 
 		 249 aa  200  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  41.99 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  38.6 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  43.97 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  44.2 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  40.79 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  44.98 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  42.61 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  45.29 
 
 		 228 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1699  alanine racemase domain protein  43.95 
 
 		 253 aa  171  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.021514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  47.11 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10850  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  53.12 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.384201  normal  0.913003 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1222  hypothetical protein  42.32 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  44.16 
 
 		 280 aa  168  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  45.89 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  44.54 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  46.78 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  43.61 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  43.48 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  40.97 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  40.97 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  41.05 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0088  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.76 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  44.98 
 
 		 283 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  41.3 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  46.75 
 
 		 286 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42.17 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  40.61 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  43.72 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  46.29 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  41.78 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  42.98 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  45.75 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  41.78 
 
 		 262 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  41.38 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  38.07 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  42.49 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  45.5 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  41.48 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  37.87 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  40.89 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.17 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  39.22 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  44.81 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  36.56 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.79 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  38.82 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  39.73 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  40.17 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  38.36 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  44.68 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  37.07 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  40.69 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  43.53 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  40.5 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  37.97 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08000  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  46.33 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0412796  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  37.07 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 228 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  38.89 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  41 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  39.51 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  38.7 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  39.02 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  39.83 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  41.38 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  41.03 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  37.93 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  41.28 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  36.56 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  34.36 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  45.15 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  40.87 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  41.85 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  37.97 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  41.41 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  46.35 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  41.63 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  36.75 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  45.15 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0685  alanine racemase domain-containing protein  38.35 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.268017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  37.44 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  38.36 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  39.15 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  39.66 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_664  alanine racemase domain protein  39.81 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0827888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  37.13 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  39.9 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  34.33 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  43.1 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  39.32 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>