More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3709 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  82.17 
 
 		 280 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  81.01 
 
 		 270 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  82.61 
 
 		 271 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  82.87 
 
 		 286 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  70.59 
 
 		 261 aa  348  5e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  70.16 
 
 		 257 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  68.88 
 
 		 261 aa  345  6e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  63.95 
 
 		 269 aa  333  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  64.91 
 
 		 259 aa  318  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  60.16 
 
 		 271 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  61.57 
 
 		 271 aa  285  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  61.41 
 
 		 262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  58.92 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  46.44 
 
 		 241 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  44.12 
 
 		 275 aa  225  6e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  47.72 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  49.56 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  45.41 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  47.92 
 
 		 244 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  50.22 
 
 		 234 aa  198  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  42.79 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  48.91 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  44.98 
 
 		 230 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  44.59 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  41.85 
 
 		 227 aa  178  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  44.89 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  43.75 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  45.12 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  45.19 
 
 		 248 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  46.98 
 
 		 229 aa  175  7e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  42.17 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  38.86 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  45.33 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  36.33 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  37 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.36 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.56 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  43.1 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  33.48 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  43.36 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  47.16 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  36.4 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  47.21 
 
 		 235 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  42.65 
 
 		 219 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  40.44 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  44.2 
 
 		 237 aa  168  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  44 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  43.61 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  44.64 
 
 		 234 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  44.2 
 
 		 230 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  41.38 
 
 		 235 aa  165  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  41.45 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  48.28 
 
 		 257 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  42.49 
 
 		 235 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  47.21 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  41.96 
 
 		 228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  41.77 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  34.5 
 
 		 219 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  46.72 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  34.5 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  42.86 
 
 		 228 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.66 
 
 		 230 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  44.02 
 
 		 229 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  34.8 
 
 		 224 aa  162  8.000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  42.19 
 
 		 241 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  39.73 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  44.33 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  43.95 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  46.22 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  44.3 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  42.6 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  44.2 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  43.75 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42.86 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  42.48 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  45.09 
 
 		 229 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  34.93 
 
 		 233 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  41.07 
 
 		 237 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  42.86 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  43.36 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  47.84 
 
 		 239 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  47.84 
 
 		 239 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  46.52 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  46.34 
 
 		 227 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  39.41 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  41.23 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  46.02 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  43.17 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  46.96 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3702  alanine racemase domain protein  49.04 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  47.62 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  47.41 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  43.27 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  47.62 
 
 		 232 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  45.85 
 
 		 223 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  42.67 
 
 		 234 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  42.67 
 
 		 234 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>