More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0478 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  67.69 
 
 		 229 aa  324  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  63.76 
 
 		 229 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  66.81 
 
 		 229 aa  305  3e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  63.76 
 
 		 229 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  58.95 
 
 		 229 aa  288  7e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  55.9 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  50.44 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  47.81 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  50.22 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  50 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  46.49 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  47.81 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  45.89 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  48.91 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  45.89 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  45.33 
 
 		 227 aa  184  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  46.32 
 
 		 228 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  44.3 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  45.89 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  45.45 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  46.32 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  44.98 
 
 		 271 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  45.89 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  44.74 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  47.19 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  44.02 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  44.54 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  40.69 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  47.32 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  44.78 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  47.53 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  41.05 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  45.02 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  43.42 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  44.59 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  44.16 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  40.43 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  48.29 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  41.99 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  48.31 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  42.98 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  45.06 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  46.32 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  43.78 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  44.69 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  40.87 
 
 		 275 aa  167  9e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  44.21 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  44.21 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.21 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  45.02 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  44.21 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  44.21 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  44.21 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.21 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  44.21 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  44.21 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  44.3 
 
 		 271 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  45.02 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  47.8 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  43.16 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  41.99 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  36.9 
 
 		 253 aa  165  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  37.89 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  41.99 
 
 		 257 aa  165  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  43.81 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  45.57 
 
 		 238 aa  164  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  41.84 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  41.88 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  44.59 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  43.72 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  41.56 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  41.56 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  43.59 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  41.56 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  41.56 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  45.02 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  42.11 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  41.38 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  43.53 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  37.66 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  37.34 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  40.69 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  46.6 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  42.11 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  41.56 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  45.81 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  42.86 
 
 		 232 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  43.1 
 
 		 235 aa  161  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  45.89 
 
 		 239 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  45.85 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  45.89 
 
 		 239 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  44.35 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  41.56 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0413  alanine racemase domain protein  44.02 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  42.36 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0421  alanine racemase domain-containing protein  44.02 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  42.06 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>