More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2739 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  53.54 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  53.1 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  50.88 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  53.02 
 
 		 242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  51.33 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  53.25 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  50.8 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  50.22 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  53.1 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  49.55 
 
 		 231 aa  201  5e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  48 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  48.67 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  50.66 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  45.37 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  43.61 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  43.36 
 
 		 227 aa  184  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  53.33 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  42.6 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  47.35 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  44.54 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  51.2 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  46.67 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  43.84 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  44.59 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  46.7 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  45.61 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  43.3 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  49.3 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  40.87 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  48.03 
 
 		 237 aa  171  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  37.35 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  47.95 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  48.03 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  36.73 
 
 		 233 aa  168  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  43.9 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  42.13 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  42.36 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  38.7 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  44.59 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  46.29 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  38.39 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  43.42 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  43.29 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  41.92 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  41.23 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  48.31 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  45.13 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  44.5 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  46.38 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  46.12 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  41.23 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  45.06 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  41.92 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  39.91 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  40.79 
 
 		 238 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  46.73 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  42.61 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  46.19 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  44.69 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  43.89 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  40.87 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  46.57 
 
 		 234 aa  161  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  43.96 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  44.49 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  45.7 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  40.35 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  43.84 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  47.49 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  41.48 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  45.69 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  41.63 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  46.44 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  44.8 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  41.74 
 
 		 242 aa  158  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  40.79 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  45.37 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  41.74 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  44.95 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  40.16 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  45.66 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  49.02 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  46.52 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  45.5 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  37.78 
 
 		 218 aa  158  8e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  42.04 
 
 		 235 aa  157  9e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.48 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  49.02 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  41.48 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  40.61 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  49.02 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  40.37 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  46.93 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  43.27 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  46.61 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  44.69 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>