More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3657 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  50.43 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  49.78 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  48.26 
 
 		 231 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  46.75 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  46.52 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  44.87 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  46.12 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  46.72 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  43.97 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  48.04 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  41.81 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  44.93 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  44.94 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  44.64 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  44.83 
 
 		 236 aa  187  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  41.63 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.79 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.91 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  44.64 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  37.12 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  39.47 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  41.28 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  36.9 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  44.21 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  42.67 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  41.2 
 
 		 238 aa  174  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  45.61 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  40.53 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  38.86 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  41.28 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  37.23 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  38.39 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  41.38 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  42.17 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  39.66 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  40.85 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  38.79 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  39.92 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  42.37 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  41.45 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  41.28 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  43.1 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  38.77 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  37.07 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  39.57 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  39.15 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  38.79 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  36.8 
 
 		 226 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  40.09 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  38.2 
 
 		 241 aa  161  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  37.93 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  34.5 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  39.3 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  41.81 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  41.13 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  40.17 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  37.66 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41.81 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  37.12 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  41.28 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  39.06 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  40.61 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  41.35 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  34.76 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  40.87 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  40.34 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  39.06 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1687  alanine racemase domain-containing protein  39.15 
 
 		 239 aa  157  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  41.74 
 
 		 240 aa  157  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  36.82 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  36.82 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.82 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  36.82 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  36.82 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.82 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  36.82 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  36.82 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  36.82 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  38.12 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  40.6 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  35.34 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  36.75 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  40.95 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  39.32 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  38.56 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  38.46 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  36.32 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  37.82 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  38.43 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  39.48 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  38.6 
 
 		 271 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  38.14 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  38.46 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>