More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1082 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  100 
 
 
225 aa  460  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  53.12 
 
 
234 aa  237  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  48.21 
 
 
226 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  49.78 
 
 
235 aa  230  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  47.79 
 
 
235 aa  217  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  47.3 
 
 
247 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  51.28 
 
 
202 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  51.11 
 
 
236 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  46.67 
 
 
230 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  48.23 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  43.86 
 
 
244 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  47.11 
 
 
237 aa  198  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  46.22 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  45.78 
 
 
231 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  41.46 
 
 
253 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  41.26 
 
 
233 aa  196  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  43.56 
 
 
228 aa  193  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  48.39 
 
 
230 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  44.89 
 
 
228 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  44.14 
 
 
225 aa  191  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  42.22 
 
 
233 aa  191  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  47.14 
 
 
234 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  44.55 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  43.5 
 
 
224 aa  187  8e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  46.31 
 
 
234 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  43.11 
 
 
229 aa  186  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  43.11 
 
 
229 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  44.09 
 
 
271 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  44.73 
 
 
244 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  44.34 
 
 
262 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  46.7 
 
 
231 aa  185  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  43.95 
 
 
233 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 
230 aa  185  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  44.34 
 
 
229 aa  184  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  46.53 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  42.29 
 
 
229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  42.55 
 
 
229 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  43.11 
 
 
224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  45.29 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  46.46 
 
 
231 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  43.56 
 
 
226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  43.23 
 
 
231 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  44 
 
 
231 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  43.89 
 
 
271 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  44.49 
 
 
229 aa  179  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  39.47 
 
 
235 aa  177  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  41.89 
 
 
235 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  40.97 
 
 
270 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  45.45 
 
 
248 aa  175  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  43.29 
 
 
229 aa  175  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  41.59 
 
 
257 aa  175  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  40.69 
 
 
229 aa  175  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  43.19 
 
 
229 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  43.61 
 
 
229 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 
241 aa  169  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  40.89 
 
 
224 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  40.89 
 
 
224 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  40.89 
 
 
224 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  40.89 
 
 
224 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  40.89 
 
 
224 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  40 
 
 
224 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  44.95 
 
 
220 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  40 
 
 
224 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  37.12 
 
 
219 aa  169  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  42.11 
 
 
220 aa  169  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  40.97 
 
 
261 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  40.44 
 
 
224 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  47.44 
 
 
214 aa  168  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  39.11 
 
 
227 aa  167  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  39.56 
 
 
229 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  41.98 
 
 
228 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  40 
 
 
224 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  46.98 
 
 
212 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  37.78 
 
 
219 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  39.65 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  42.6 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  40.36 
 
 
280 aa  165  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  44.16 
 
 
222 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  44.16 
 
 
222 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  39.82 
 
 
229 aa  164  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  40.39 
 
 
219 aa  164  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  42.15 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  40.44 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  39.56 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  40.97 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  38.22 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  38.67 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  42.04 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  38.22 
 
 
222 aa  162  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  41.7 
 
 
240 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  42.38 
 
 
240 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  41.7 
 
 
229 aa  161  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  40.93 
 
 
244 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  40.45 
 
 
259 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  40.18 
 
 
236 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  41.33 
 
 
236 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  40 
 
 
241 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  40.89 
 
 
227 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>