More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1904 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  76.13 
 
 		 226 aa  358  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  60.36 
 
 		 224 aa  293  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  58.11 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  58.11 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  58.11 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  58.11 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  58.11 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  58.11 
 
 		 224 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  58.11 
 
 		 224 aa  286  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  58.56 
 
 		 224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  58.11 
 
 		 224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  58.11 
 
 		 224 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  55.91 
 
 		 222 aa  254  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  55.91 
 
 		 222 aa  254  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  55.41 
 
 		 222 aa  254  6e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  45.25 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  44.89 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0480  ylmE protein, putative  42.53 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  46.9 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  43.56 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  43.11 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  44.1 
 
 		 244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  44.44 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  44.25 
 
 		 228 aa  174  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  44.64 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  44.44 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  42.79 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  40.62 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  42.11 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  43.24 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  38.57 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  41.33 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  44.14 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  41.52 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  41.52 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  42.22 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  42.73 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  41.44 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  41.84 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  42.08 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  40.71 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  40.72 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  43.56 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  42.29 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  40.71 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  42.57 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  40 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  42.34 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  42.29 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  41.33 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  42.79 
 
 		 259 aa  161  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  42.61 
 
 		 270 aa  161  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  43.04 
 
 		 280 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  39.38 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  36.89 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  37.17 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  37.33 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.77 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  40.62 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  40.85 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  43.95 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  38.05 
 
 		 244 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09440  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  41.59 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000968769  normal  0.0803306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  37.39 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  39.82 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  37.05 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  40.27 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  38.84 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  34.82 
 
 		 275 aa  148  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  40.62 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  42.65 
 
 		 213 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  42.22 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.05 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  39.83 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  40.66 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  37.17 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  43.11 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  39.38 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  35.96 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  38.53 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  38.94 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  39.38 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  39.82 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  37 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  38.33 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2084  alanine racemase domain protein  46.6 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000045543  hitchhiker  0.0000000000000968323 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  36.16 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  37.12 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  37.83 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  36.56 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  36.28 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  32.52 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  36.28 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  40.18 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  37 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  38.39 
 
 		 229 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>