More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2084 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2084  alanine racemase domain protein  100 
 
 
234 aa  475  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000045543  hitchhiker  0.0000000000000968323 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09440  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  57.46 
 
 
230 aa  261  6e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000968769  normal  0.0803306 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08910  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  52.38 
 
 
234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0151637  hitchhiker  0.0000000329342 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  40.35 
 
 
229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  40.35 
 
 
229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  38.77 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  46.26 
 
 
224 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  41.81 
 
 
227 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  40.77 
 
 
244 aa  154  8e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  39.29 
 
 
225 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  41.4 
 
 
226 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  38.05 
 
 
229 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  41.86 
 
 
231 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  42.18 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  33.78 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  39.11 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  40.65 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  38.79 
 
 
225 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  43.6 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  36.79 
 
 
234 aa  138  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  39.13 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  38.05 
 
 
226 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  40.28 
 
 
229 aa  137  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  36.94 
 
 
228 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  40 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  39.6 
 
 
236 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.45 
 
 
271 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41.15 
 
 
228 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  38.32 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  38.91 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  38.91 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  38.91 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.91 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  39.74 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.76 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  36.28 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  35.84 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  38.91 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  39.15 
 
 
224 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.15 
 
 
224 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  40.87 
 
 
235 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  42.23 
 
 
228 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  40.87 
 
 
231 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  38.68 
 
 
224 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  39.22 
 
 
234 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.17 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  41.1 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 
229 aa  129  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  40.19 
 
 
228 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.46 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  40.47 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  32.14 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  37.28 
 
 
228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  38.01 
 
 
224 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  39.91 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  36.74 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  38.46 
 
 
228 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  38.07 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  126  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  34.27 
 
 
235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  34.21 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 
231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  36.36 
 
 
235 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  37.85 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  40.28 
 
 
230 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  39.45 
 
 
238 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.28 
 
 
229 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  39.47 
 
 
229 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  40.19 
 
 
228 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  39.59 
 
 
222 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  39.59 
 
 
222 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  40.29 
 
 
236 aa  124  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  38.36 
 
 
232 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  34.69 
 
 
202 aa  124  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  40.67 
 
 
228 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  37.9 
 
 
280 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  41.23 
 
 
229 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  35.29 
 
 
223 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  35.29 
 
 
226 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  42.06 
 
 
228 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  40.39 
 
 
227 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  34.95 
 
 
233 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  38.12 
 
 
234 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  31.49 
 
 
253 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  36.87 
 
 
257 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  39.9 
 
 
223 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 
224 aa  122  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  35.04 
 
 
231 aa  122  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  38.07 
 
 
222 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  34.87 
 
 
216 aa  121  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  39.9 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  35.94 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0294  hypothetical protein  31.17 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  30.57 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  35.94 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  34.82 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  34.96 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  32.3 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>