More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1237 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  95.79 
 
 		 261 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  71.49 
 
 		 270 aa  347  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  70.21 
 
 		 280 aa  344  6e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  67.62 
 
 		 271 aa  326  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  67.06 
 
 		 286 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  70.59 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  64.68 
 
 		 257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  62.18 
 
 		 269 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  60.34 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  54.88 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  54.51 
 
 		 271 aa  258  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  58.67 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  56.77 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  47.19 
 
 		 244 aa  198  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  42.74 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  45.11 
 
 		 241 aa  195  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  46.96 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  44.16 
 
 		 243 aa  188  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  42.5 
 
 		 244 aa  178  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  40.95 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  43.29 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  40.97 
 
 		 225 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  44.1 
 
 		 229 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.16 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  40.69 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  34.91 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  39.65 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  40.71 
 
 		 224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  41.56 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  40.26 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  41.48 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  43.86 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  41.13 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  39.22 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  39.21 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  41.63 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  44.39 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  40.08 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  40.97 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 232 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  42.92 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  36.12 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  40.83 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  37.99 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  38.6 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  44.88 
 
 		 227 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  41.58 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  44.88 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  40.35 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  36.56 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  40.27 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  41.77 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  36.24 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  34.27 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  42.06 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  37.77 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  41.05 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  43.2 
 
 		 213 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08000  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  45.58 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0412796  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  37.55 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  35.09 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  44.39 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.1 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  43.04 
 
 		 238 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  38.77 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  41.13 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  37.72 
 
 		 231 aa  149  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  38.33 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  39.21 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  38.81 
 
 		 228 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  37.4 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  36.17 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  38.77 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  34.36 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  40.79 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  41.05 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  36.84 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  37.44 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  39.47 
 
 		 229 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  34.78 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  35.27 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  39.21 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  36.56 
 
 		 237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  37.34 
 
 		 239 aa  145  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  38.77 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  40.79 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  39.83 
 
 		 228 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.16 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  38.33 
 
 		 228 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  37.76 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  40.38 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  37.89 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  40.53 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  38.77 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>