More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1315 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  100 
 
 
233 aa  481  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  43.42 
 
 
234 aa  210  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  41.26 
 
 
225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  40.53 
 
 
224 aa  187  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  39.06 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  39.21 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  41.15 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  47.21 
 
 
202 aa  181  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  40 
 
 
235 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  38.77 
 
 
233 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  36.56 
 
 
235 aa  174  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  38.1 
 
 
234 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  36.84 
 
 
236 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  36.68 
 
 
262 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  36.24 
 
 
271 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.32 
 
 
230 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  40.35 
 
 
225 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  40.81 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  35.24 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  37.12 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 
234 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  38.16 
 
 
230 aa  165  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  35.81 
 
 
235 aa  165  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  37.95 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  35.71 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  37.95 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  39.5 
 
 
231 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.91 
 
 
224 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  33.77 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  35.53 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  35.53 
 
 
228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  34.93 
 
 
237 aa  161  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  37.39 
 
 
240 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  38.7 
 
 
230 aa  161  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  39.46 
 
 
224 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  39.46 
 
 
224 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.47 
 
 
224 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  39.47 
 
 
224 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  39.47 
 
 
224 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  39.47 
 
 
224 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  39.47 
 
 
224 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.46 
 
 
224 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  39.46 
 
 
224 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  35.62 
 
 
244 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  34.76 
 
 
235 aa  159  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  39.83 
 
 
243 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  42.15 
 
 
219 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  36.73 
 
 
231 aa  158  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  34.36 
 
 
257 aa  158  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  39.01 
 
 
226 aa  157  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  36.68 
 
 
235 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  34.14 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  37.07 
 
 
229 aa  154  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  37.33 
 
 
224 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  37 
 
 
224 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  35.53 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 
220 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  35.09 
 
 
261 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  34.63 
 
 
275 aa  149  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  36.68 
 
 
229 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  37.38 
 
 
219 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  40 
 
 
219 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.22 
 
 
231 aa  148  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  35.71 
 
 
269 aa  148  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  32.59 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  33.2 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  37.66 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  35.24 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  36.63 
 
 
227 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  33.04 
 
 
259 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  33.62 
 
 
227 aa  146  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  34.47 
 
 
242 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  31.88 
 
 
234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  33.06 
 
 
242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  36.94 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  37.13 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  36.63 
 
 
218 aa  145  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 
229 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  34.22 
 
 
280 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 
222 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  39.3 
 
 
216 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 
222 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  30.97 
 
 
229 aa  144  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 
229 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 
231 aa  144  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  32.31 
 
 
228 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  35.09 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  29.79 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  33.77 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  35.47 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  32.5 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  35.19 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  32.74 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  31.49 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  38.42 
 
 
220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  37.67 
 
 
222 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0480  ylmE protein, putative  34.67 
 
 
224 aa  138  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  30.77 
 
 
241 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  31.56 
 
 
237 aa  138  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>