More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2208 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 272 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  61.11 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  57.03 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  56.3 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  55.07 
 
 		 235 aa  221  9e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  50.8 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  48.36 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  39.36 
 
 		 224 aa  196  5.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  43.82 
 
 		 227 aa  195  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  44.31 
 
 		 230 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  45.24 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  44.88 
 
 		 228 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  45.02 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  47.64 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  43.37 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  43.14 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  49.39 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  46.22 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  47.01 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  41.73 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  46.96 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  46.35 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  51.29 
 
 		 243 aa  185  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  46.35 
 
 		 228 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  45.75 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  46.96 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  45.63 
 
 		 228 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  43.15 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  43.03 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  38.8 
 
 		 230 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  47.83 
 
 		 213 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  43.85 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  45.63 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  42.69 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  45.2 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  47.74 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  44 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  47.37 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  45.08 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  45.75 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  45.93 
 
 		 234 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  46.22 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.76 
 
 		 231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  47.01 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  48.58 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  45.53 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  42.86 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  46.22 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  42.08 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  43.65 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  47.77 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  41.56 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  42.11 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  48.16 
 
 		 240 aa  165  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  40.74 
 
 		 232 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  40.74 
 
 		 242 aa  165  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  43.22 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  42.25 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  47.15 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  42.57 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  44.8 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  41.76 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  44.8 
 
 		 229 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  37.6 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  39.13 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  42.04 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  36.8 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  38.4 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  49.19 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  41.94 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  48.65 
 
 		 239 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  48.65 
 
 		 239 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  35.43 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  46.72 
 
 		 238 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  44.78 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  44.4 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  41.6 
 
 		 244 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  40.74 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  41.44 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  37.2 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  45.56 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1883  alanine racemase domain-containing protein  38.19 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2418  hypothetical protein  46.29 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  38.65 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  40.23 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  48.03 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  49.19 
 
 		 232 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3702  alanine racemase domain protein  48.47 
 
 		 237 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  35.71 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  47.6 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  37.7 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  37.2 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  40.16 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  40.33 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  37.2 
 
 		 238 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  37.8 
 
 		 235 aa  155  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  43.68 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  36.51 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  41.6 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  41.6 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>