More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3024 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  66.67 
 
 		 221 aa  280  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  69.63 
 
 		 191 aa  257  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  60.48 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  60.09 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  59.62 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  61.65 
 
 		 227 aa  232  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  56.88 
 
 		 219 aa  231  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  57.28 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  59.62 
 
 		 221 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  58.64 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  54.55 
 
 		 225 aa  228  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  55.81 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  56.81 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  56.22 
 
 		 225 aa  226  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  56.34 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  58.22 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  55.87 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  57.77 
 
 		 219 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  55.35 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  56.28 
 
 		 230 aa  221  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  52.83 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  55.5 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  54.55 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  54.09 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  52.75 
 
 		 219 aa  214  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  53.64 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  56.7 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  53.18 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  51.42 
 
 		 218 aa  204  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  51.83 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  50.23 
 
 		 220 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  50.23 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  49.77 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  47.17 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  50.7 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  49.03 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  45.19 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  49.77 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  52.34 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  51.28 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  50.72 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  56.25 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  40.83 
 
 		 219 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  44.3 
 
 		 230 aa  154  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  43.23 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  42.79 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  41.05 
 
 		 244 aa  151  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  41.48 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  45.18 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  43.42 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  43.05 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  43.06 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  43.06 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  39.56 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  39.74 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  43.72 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  44.3 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  42.8 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  43.54 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  41.52 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  38.18 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  45.78 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  48.93 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  40.27 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  36.16 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  47.37 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  41.95 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  43.3 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  44.1 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  42.41 
 
 		 241 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  40.83 
 
 		 238 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42.98 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  46.05 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  39.15 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  44.3 
 
 		 229 aa  137  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  44.55 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  46.72 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  39.13 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  43.2 
 
 		 222 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  46.02 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  40.89 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  44.16 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  38.96 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  46.05 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  40.08 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  43.17 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  44.44 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.84 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  40.08 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  39.58 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  44.68 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  40.08 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  42.31 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  40.99 
 
 		 229 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  43.3 
 
 		 234 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.7 
 
 		 234 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>