More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6102 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 247 aa  490  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  64.22 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  59.74 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  62.77 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  57.02 
 
 		 240 aa  238  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  57.45 
 
 		 234 aa  232  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  60.29 
 
 		 242 aa  231  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  52.08 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  53.91 
 
 		 248 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  54.81 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  58.42 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  54.81 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  50 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  52.72 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  59.71 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  49.8 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  49.78 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  47.15 
 
 		 346 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  48.76 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  54.84 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  40.19 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  47.06 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  43.53 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  43.44 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  41.87 
 
 		 279 aa  154  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  40.31 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  37.99 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  41.92 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  41.53 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  35.98 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  39.66 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  39.66 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.66 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  39.66 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.66 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  39.66 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  39.66 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  39.66 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  39.66 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 230 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  42.17 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  36.91 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  41.7 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  38.2 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.03 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  37.77 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  35.98 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  42.44 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  39.22 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.22 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.22 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  39.22 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  42.17 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  39.3 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  40.69 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  42.42 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  42.45 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  42.32 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  42.92 
 
 		 221 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  38.79 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  43.53 
 
 		 229 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3357  alanine racemase domain-containing protein  38.56 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  38.94 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  34.76 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  40.52 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  40.43 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  42.04 
 
 		 254 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  37.13 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  42.04 
 
 		 254 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  36.21 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  40.09 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  41.55 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  40.95 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  40.51 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  36.82 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  34.58 
 
 		 231 aa  134  9e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  36.68 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  39.48 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  40.77 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  42.8 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  41.1 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  40.61 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  41.85 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  40.08 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  40.09 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  35.15 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  35.17 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  37.18 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  39.66 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  35.17 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  35.59 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  41.41 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  32.9 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  38.17 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  36.8 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  39.06 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  37.23 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01992  hypothetical protein  39.91 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  37.07 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>