More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4007 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  52.28 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  53.44 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  51.61 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  50.41 
 
 		 247 aa  204  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  50.83 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  52.16 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  49.56 
 
 		 231 aa  194  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  49.58 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  51.52 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  52.7 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  46.89 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  47.64 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  51.66 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  48.94 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  49.58 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  44.21 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  42.17 
 
 		 258 aa  158  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  43.44 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  48.31 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  40.51 
 
 		 346 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  43.78 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  46.53 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  34.36 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  32.91 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  46.51 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  41.95 
 
 		 259 aa  135  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  39.01 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  39.73 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0930  alanine racemase domain protein  44.74 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246462  normal  0.758463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  40.44 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  39.52 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  36.84 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  36.24 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  36.24 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  36.24 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  36.24 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  36.24 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.24 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  36.24 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.24 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  36.24 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  32.48 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  38.6 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  36.96 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  41.01 
 
 		 227 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  40.35 
 
 		 228 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  36.21 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  39.11 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  39.11 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  36.73 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  35.81 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  37 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  32.76 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  32.02 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  37.17 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  39.73 
 
 		 230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  35.81 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  35.81 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  35.81 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  35.81 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  38.36 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  35.11 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  36.94 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  37.34 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  37.83 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  38.6 
 
 		 228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  36.89 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  34.06 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3357  alanine racemase domain-containing protein  37.28 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  38.53 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  34.35 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  38.16 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  32.31 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  36.8 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  30.84 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  37.83 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  37.98 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  35.96 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  36.44 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  38.1 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  36.56 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  40.4 
 
 		 199 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  36.99 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  33.04 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  33.05 
 
 		 233 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  35.27 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  34.98 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  38.77 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  38.26 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  38.13 
 
 		 272 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  37.18 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  32.46 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  38.43 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  36.61 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  35.74 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  35.65 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>