More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1575 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  475  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  68.62 
 
 		 245 aa  305  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  54.32 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  60.1 
 
 		 244 aa  214  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  52.92 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  52.38 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  55.17 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  52.48 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  50.4 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  51.85 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  53.6 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  50.85 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  50.64 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  56.94 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  52.71 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  50.67 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  45.3 
 
 		 244 aa  168  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  44.8 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  47.09 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  42.37 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  43.55 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  45.85 
 
 		 254 aa  158  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  46.89 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  43.51 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  37.82 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  42.26 
 
 		 346 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  39.32 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  41.94 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  41.94 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  41.94 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  43.72 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  36.64 
 
 		 276 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  39.13 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  41.74 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  35.5 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  38.79 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  32.92 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.26 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  36.36 
 
 		 271 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  36.02 
 
 		 233 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  35.34 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  36.68 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  36.29 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0930  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246462  normal  0.758463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  36.8 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  36.52 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  41.38 
 
 		 220 aa  125  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  39.53 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  39.62 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  39.53 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  36.71 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  37.29 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  34.31 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  34.78 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  36.59 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  36.52 
 
 		 228 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  32.19 
 
 		 234 aa  121  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  39.22 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  34.73 
 
 		 244 aa  121  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  37.07 
 
 		 242 aa  121  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  33.79 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  36.55 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  37.77 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  32.91 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  40.5 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  34.47 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  34.04 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  34.62 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  33.19 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  34.6 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  36.12 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  34.19 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  34.04 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  34.04 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  37.45 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  32.46 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  37.93 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  34.93 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  37.13 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  32.2 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  37.83 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  34.76 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  36.17 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  34.62 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  34.62 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  34.62 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  31.93 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  32.22 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  37.89 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  39.06 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  34.62 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  34.62 
 
 		 234 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  33.62 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  37.25 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  36.84 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  34.32 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  38.2 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  35.32 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>