More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5092 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  617  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  55.27 
 
 		 346 aa  252  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  40.51 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  43.26 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  41.8 
 
 		 248 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  40.46 
 
 		 249 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  42.02 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  40.13 
 
 		 244 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  39.8 
 
 		 231 aa  165  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  43.77 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.1 
 
 		 244 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  41.31 
 
 		 240 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  39.87 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  42.39 
 
 		 246 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  35.95 
 
 		 236 aa  146  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  38.46 
 
 		 242 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  49.46 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  49.73 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  36.42 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  49.15 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  34.6 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  34.84 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  39.43 
 
 		 238 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  34.65 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  27.1 
 
 		 228 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  34.18 
 
 		 191 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  33.77 
 
 		 237 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  32.69 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  33 
 
 		 237 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  35.02 
 
 		 221 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  35.16 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  30.39 
 
 		 226 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  25.81 
 
 		 253 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  27.16 
 
 		 239 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  31.88 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  30.87 
 
 		 228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  32.17 
 
 		 228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  31.58 
 
 		 228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  27.69 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  34.87 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  32.91 
 
 		 234 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  32.68 
 
 		 232 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  27.36 
 
 		 232 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  26.47 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  31.58 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  24.83 
 
 		 235 aa  112  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  27.36 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  31.05 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  34.21 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  42.86 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  30.92 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  30.45 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  35.1 
 
 		 238 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  30.94 
 
 		 270 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  25.25 
 
 		 230 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  32.89 
 
 		 228 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  31.7 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  27.12 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  30.62 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  32.69 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  28.39 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  35 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  26.14 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  27.04 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  33.54 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  27.04 
 
 		 227 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  33.45 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  33.45 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  30.67 
 
 		 229 aa  106  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  32.8 
 
 		 230 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  27.96 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  34.44 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  26.47 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  33.45 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  31.09 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  31.82 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  26.47 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  29 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  30.52 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0294  hypothetical protein  26.77 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  33.01 
 
 		 230 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  28.29 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  26.14 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  29.81 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  30.84 
 
 		 229 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  26.33 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  29.97 
 
 		 232 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  32.76 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  28.29 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  27.12 
 
 		 238 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  27.12 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  30.8 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  30.13 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  28.81 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  23.78 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  25.56 
 
 		 235 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  24.75 
 
 		 225 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  25.31 
 
 		 239 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>