More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1411 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  70.71 
 
 		 234 aa  315  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  69.66 
 
 		 244 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  64.53 
 
 		 240 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  59.74 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  58.37 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  59.91 
 
 		 242 aa  244  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  58.9 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  54.51 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  55.46 
 
 		 231 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  56.15 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  53.91 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  62.07 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  52.67 
 
 		 244 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  54.27 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  54.73 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  49.59 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  48.72 
 
 		 346 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  49.36 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  51.21 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  39.8 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  49.55 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  44.1 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  43.87 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  44.67 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 		 279 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  42.31 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  35.04 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  41.74 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42.04 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  43.59 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  40.69 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  42.91 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  42.91 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  42.91 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  37.89 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  34.76 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  40.17 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0930  alanine racemase domain protein  43.67 
 
 		 225 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246462  normal  0.758463 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  33.04 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  39.83 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  39.11 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  37.07 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  39.74 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  37.83 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  34.62 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  39.04 
 
 		 228 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.2 
 
 		 229 aa  139  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  39.66 
 
 		 230 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  36.96 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  41.15 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  37.34 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  38.46 
 
 		 261 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  36.05 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  39.13 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  38.46 
 
 		 261 aa  134  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  39.66 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  40.35 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  32.63 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  36.61 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  40.35 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  35.22 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  39.11 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  34.78 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  38.36 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  35.04 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  39.47 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  37.7 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  34.19 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  38.67 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.48 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  39.82 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  39.15 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  43.56 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  36.48 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  33.77 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  36.48 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.48 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  34.06 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  36.4 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  35.78 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  42.26 
 
 		 242 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  36.49 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  36.48 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  31.34 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  35.65 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  33.91 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  34.62 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  39.82 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  30.43 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  38.7 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  33.94 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  41.75 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  35.27 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  35.48 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  36.63 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  40.95 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>