More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI01490 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI01490  conserved hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  531  1e-150  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  48.65 
 
 
237 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07017  alanine racemase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04300)  46.27 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361048  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48387  predicted protein  50 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.181338 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_5512  predicted protein  43.89 
 
 
250 aa  178  9e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.050444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  41.37 
 
 
229 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  39.39 
 
 
242 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  39.43 
 
 
231 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  41.3 
 
 
235 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  41.13 
 
 
238 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  41.42 
 
 
227 aa  141  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  41.94 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  38.91 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  40.65 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  41.53 
 
 
228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  41.53 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  42.06 
 
 
233 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  40.99 
 
 
235 aa  139  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  41.53 
 
 
238 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  39.58 
 
 
228 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  40.08 
 
 
230 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 
234 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  44.55 
 
 
235 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  40.24 
 
 
234 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.5 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  39.52 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.4 
 
 
229 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  39.92 
 
 
232 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  41.1 
 
 
241 aa  135  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  42.08 
 
 
232 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 
239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  37.96 
 
 
231 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  37.5 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  39.11 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  36.89 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  40.65 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  39.27 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  34.8 
 
 
235 aa  132  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  38.1 
 
 
236 aa  132  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  38.71 
 
 
232 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  38.46 
 
 
280 aa  131  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  39.92 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  39.92 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 
232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  39.92 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  37.7 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.92 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  39.92 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  39.92 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.92 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  39.92 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  39.52 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  38.87 
 
 
228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  39.92 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  36.53 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  35.34 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  38.25 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  40.31 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  37.8 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  38.64 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  38.74 
 
 
234 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  42.34 
 
 
202 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  39.91 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  37.1 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  38.46 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  40.94 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  40.27 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  39.47 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  39.37 
 
 
236 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  35.62 
 
 
220 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  40.55 
 
 
231 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  38.25 
 
 
232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  34.14 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  38.58 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.34 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  38.34 
 
 
234 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  36.44 
 
 
225 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  38.34 
 
 
234 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.34 
 
 
234 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  42.73 
 
 
237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  39.04 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  39.61 
 
 
229 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  39.55 
 
 
229 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  39.37 
 
 
228 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  38.11 
 
 
233 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  37.1 
 
 
228 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  41.96 
 
 
231 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  40.27 
 
 
239 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  40.08 
 
 
229 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  40.27 
 
 
239 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  37.65 
 
 
237 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  38.91 
 
 
228 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  33.74 
 
 
222 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  38.57 
 
 
239 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  36.22 
 
 
244 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  36.99 
 
 
225 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  41.1 
 
 
239 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  38.71 
 
 
227 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  36.25 
 
 
233 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  37.7 
 
 
229 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>