More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_5512 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_5512  predicted protein  100 
 
 		 250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.050444  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  55.91 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01490  conserved hypothetical protein  43.89 
 
 		 259 aa  178  9e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  41.32 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07017  alanine racemase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04300)  46.15 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  37.75 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  39.84 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  39.27 
 
 		 233 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  42.51 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  38.06 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  38 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  40.56 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  41.7 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  40.24 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  40.24 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.24 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  40.24 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  40.24 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.24 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  40.24 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  40.24 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  40.24 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  35.59 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  38.87 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  40.57 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  38.96 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48387  predicted protein  36.11 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.181338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  38.21 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.21 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  38.21 
 
 		 234 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  38.21 
 
 		 234 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  37.35 
 
 		 242 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  38.55 
 
 		 238 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.21 
 
 		 234 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4030  alanine racemase domain-containing protein  39.6 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  39.09 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  38.55 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  40.25 
 
 		 226 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  38.21 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  38.06 
 
 		 237 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  38.06 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  35.77 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  36.99 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  40.08 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  38.43 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  33.61 
 
 		 235 aa  135  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  40.89 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  37.98 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  38 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  40.08 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  38.4 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  37.4 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  37.1 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  37.35 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  38.25 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  38 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  37.05 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  37.5 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  38.62 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  36.63 
 
 		 229 aa  132  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  37.9 
 
 		 231 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  35.32 
 
 		 275 aa  131  7.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  38.43 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  37.25 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  37.45 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  40.91 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  36.21 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.86 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  37.2 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  39.34 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  36.44 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  37.2 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  37.65 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  37.6 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  37.87 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  35.86 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  39.83 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  37.55 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  37.85 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  36.99 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  34.38 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  35.46 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  37.05 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  38.91 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  35.46 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  36.13 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3357  alanine racemase domain-containing protein  39.84 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164594 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  40.28 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  36.03 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  37.76 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  36.73 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  40.61 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  38.91 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  38.64 
 
 		 202 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  36.07 
 
 		 229 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  34.94 
 
 		 230 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  36.25 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  36.51 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>