More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0859 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0859  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0608  hypothetical protein  69.95 
 
 
215 aa  279  2e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1134  hypothetical protein  64.53 
 
 
211 aa  263  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0125  hypothetical protein  63.29 
 
 
212 aa  252  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0742  hypothetical protein  59.42 
 
 
210 aa  252  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.14664  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0819  hypothetical protein  59.42 
 
 
210 aa  252  3e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1287  hypothetical protein  59.42 
 
 
210 aa  251  7e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.472331  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0749  hypothetical protein  57.49 
 
 
205 aa  246  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0140325  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1062  alanine racemase domain protein  53.06 
 
 
225 aa  209  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1235  hypothetical protein  53.33 
 
 
224 aa  202  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  37.93 
 
 
231 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.66 
 
 
224 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  37.06 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  33.96 
 
 
259 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  32.56 
 
 
224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  38.68 
 
 
219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  35.32 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  34.68 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  35.2 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  30.7 
 
 
257 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  33.96 
 
 
230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  32.66 
 
 
247 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  33.17 
 
 
219 aa  114  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  35.64 
 
 
235 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  34.8 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  34.83 
 
 
275 aa  112  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  32.32 
 
 
234 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  32.99 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  38.21 
 
 
219 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  31.68 
 
 
235 aa  111  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  34 
 
 
218 aa  111  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  32.5 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  36.97 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  33.5 
 
 
269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  35 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  32.66 
 
 
226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  35.86 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  31.19 
 
 
244 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  36.45 
 
 
222 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  35.86 
 
 
224 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  35.71 
 
 
228 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  33.67 
 
 
227 aa  108  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  32.34 
 
 
231 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  35.82 
 
 
233 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  35.68 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  34.6 
 
 
222 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  33.89 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  33.33 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  33.5 
 
 
238 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  35.71 
 
 
228 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  33.82 
 
 
236 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  30.62 
 
 
276 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  29.77 
 
 
234 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  33.5 
 
 
238 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  35.82 
 
 
229 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  31.71 
 
 
225 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  35.86 
 
 
234 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  35.5 
 
 
235 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  34.87 
 
 
239 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  35.35 
 
 
224 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  36.89 
 
 
229 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  33.17 
 
 
224 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  34.34 
 
 
233 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  30.85 
 
 
229 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  31.66 
 
 
234 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  30.85 
 
 
229 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  33 
 
 
238 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  34.85 
 
 
229 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  34.22 
 
 
236 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  34.85 
 
 
224 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  31.8 
 
 
238 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  34.44 
 
 
230 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  34.85 
 
 
224 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  35.86 
 
 
230 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  31.34 
 
 
270 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  32.34 
 
 
220 aa  104  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  35.1 
 
 
211 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  34.85 
 
 
224 aa  104  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  34.65 
 
 
236 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  35.5 
 
 
244 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  35.44 
 
 
231 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  35.03 
 
 
228 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  34.52 
 
 
229 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  33.65 
 
 
213 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  35.38 
 
 
224 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  34.6 
 
 
224 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  33.98 
 
 
229 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  33.83 
 
 
232 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  36.36 
 
 
211 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  31.53 
 
 
220 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  32.34 
 
 
228 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  34.56 
 
 
233 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01490  conserved hypothetical protein  34.1 
 
 
259 aa  102  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  34 
 
 
232 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  32.12 
 
 
199 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  35.64 
 
 
220 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  32.21 
 
 
227 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2418  hypothetical protein  34.52 
 
 
246 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  31.86 
 
 
230 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>