More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0749 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0749  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0140325  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0819  hypothetical protein  74.16 
 
 		 210 aa  305  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0742  hypothetical protein  74.16 
 
 		 210 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.14664  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1287  hypothetical protein  74.16 
 
 		 210 aa  302  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.472331  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0608  hypothetical protein  62.76 
 
 		 215 aa  249  3e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0859  hypothetical protein  57.49 
 
 		 205 aa  246  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0125  hypothetical protein  55.56 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1134  hypothetical protein  52.15 
 
 		 211 aa  221  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1062  alanine racemase domain protein  47.96 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1235  hypothetical protein  46.46 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  42 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  39.13 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  35.1 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  35.58 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  37.44 
 
 		 229 aa  115  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.15 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  33.83 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  36.41 
 
 		 229 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  35 
 
 		 233 aa  114  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  39.42 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  37.19 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  35.55 
 
 		 222 aa  112  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  111  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  34.83 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  36.14 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  31.5 
 
 		 271 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  35.96 
 
 		 229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  35.53 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  37.31 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  37.31 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  35.64 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  35 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01490  conserved hypothetical protein  36.57 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  32 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  36.22 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  35.35 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  35.32 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  29.21 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0159  alanine racemase domain protein  37.26 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00156899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  33.01 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  30.62 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  33 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_5512  predicted protein  34.7 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.050444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  34 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  32.21 
 
 		 224 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  32.84 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  30.15 
 
 		 262 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  32.67 
 
 		 280 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  34.65 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  33.64 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  34 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  35.61 
 
 		 275 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48387  predicted protein  36.7 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.181338 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  32.83 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  34.78 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  32.22 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  32.16 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  31.31 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  33.99 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  34.52 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0088  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  35.91 
 
 		 266 aa  102  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  31.37 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  28.78 
 
 		 271 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  35.87 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  34.69 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  35.29 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  30.35 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  32.83 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  33.83 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  36.89 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  32.68 
 
 		 241 aa  101  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  32.89 
 
 		 253 aa  101  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  33 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  34.48 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  33.99 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  30.5 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  34.33 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  33.5 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  33.5 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  33.5 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  38 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  34.16 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  33.5 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  36.89 
 
 		 229 aa  99.8  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  33.5 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  33.17 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  32.32 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  33 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  32.34 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  33.84 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  32.51 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0480  ylmE protein, putative  30.2 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  32.16 
 
 		 223 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  33.99 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  32.23 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  31.68 
 
 		 270 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  33 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>