More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1235 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1235  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  462  1e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1062  alanine racemase domain protein  55.8 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1134  hypothetical protein  54.59 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0608  hypothetical protein  48.84 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0125  hypothetical protein  52.55 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0859  hypothetical protein  53.33 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1287  hypothetical protein  49.75 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.472331  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0819  hypothetical protein  50.76 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0742  hypothetical protein  50.76 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.14664  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0749  hypothetical protein  46.46 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0140325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  40.2 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.78 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  33.82 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0159  alanine racemase domain protein  37.16 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00156899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  34.48 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  37.62 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  33.83 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  34.35 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  35.96 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  33.63 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  35.64 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  37.62 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  35.48 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  34.63 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  32.35 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  33.83 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  35.78 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  35.44 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  31.6 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  34.95 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  33.63 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  32.03 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  32.16 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  32.34 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  36 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  34.31 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  35.86 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  35 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  34.85 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  33.84 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  35 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.32 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  34.65 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  32.51 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  32.54 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  33.03 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  31.6 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  33.17 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  34.15 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  33.03 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  36.09 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  33.99 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  32.33 
 
 		 261 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  34.8 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  34.47 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  31.84 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  34.38 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  32.56 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  31.78 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  32.52 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  33.17 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  31.51 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  37.26 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  31.7 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  36.5 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  34.98 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  32.03 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  34.65 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  31.68 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3702  alanine racemase domain protein  34.47 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  31.39 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  32.02 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  33.91 
 
 		 227 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  33.5 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  31.68 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  34.83 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  34.58 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  33.48 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  34.16 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  33.93 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  32.52 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  31.28 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  30.2 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  33 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  32.52 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  33.01 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  32.37 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  33 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  33 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0480  ylmE protein, putative  33.19 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  34.23 
 
 		 229 aa  111  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  35.32 
 
 		 269 aa  111  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  31.05 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  31.64 
 
 		 255 aa  111  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  31.66 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>