More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0452 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0452  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 258 aa  531  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.92 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  39.26 
 
 		 225 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  35.6 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  33.47 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  34.29 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  33.73 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  37.96 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  35.57 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  33.47 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  36.03 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  35.25 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  38.25 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.4 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  36.07 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  37.45 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  34.62 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  37.28 
 
 		 236 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  35.08 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  36.21 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  36.84 
 
 		 270 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0480  ylmE protein, putative  34.89 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  35.25 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  37.45 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  34.58 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  36.14 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  32.13 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  37.14 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  36.48 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  35 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  31.82 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  35.25 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  31.56 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  35.09 
 
 		 222 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  36.36 
 
 		 228 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 		 229 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  35.87 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  29.34 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  35.89 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  34.78 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  36.63 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  33.06 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  33.77 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  31.3 
 
 		 229 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  31.3 
 
 		 229 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  36.59 
 
 		 244 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  34.43 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  32.64 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  32.84 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  34.55 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  35.95 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  33.59 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  36 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  37.05 
 
 		 286 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  35.37 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  35.12 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  34.57 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  34.84 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  34.67 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  34.01 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3523  alanine racemase domain protein  34.29 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.758278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  31.15 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  30.86 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  36.16 
 
 		 219 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  36.02 
 
 		 219 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  33.61 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  32.38 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  34.01 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  35.12 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  30.45 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  31.58 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  30.45 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  33.61 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  35.27 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  30.45 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  30.45 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  30.45 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  30.45 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  34.55 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  32.33 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  32.92 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  31.2 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  30.45 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  34.73 
 
 		 231 aa  107  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  32.81 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  31.69 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  29.52 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  35.43 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  35.2 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  30.45 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  32.92 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  34.85 
 
 		 220 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0819  hypothetical protein  32.3 
 
 		 210 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0742  hypothetical protein  32.3 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.14664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  33.61 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  36.05 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  34.96 
 
 		 217 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>