More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3502 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3502  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
654 aa  1320    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1378  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.36 
 
 
639 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1513  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.09 
 
 
639 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0040  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.29 
 
 
657 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0248  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.81 
 
 
658 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00203639  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3566  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.86 
 
 
660 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0145214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0193  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.67 
 
 
658 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000108567  normal  0.0553743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4656  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.94 
 
 
659 aa  485  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724675  hitchhiker  0.00321654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4284  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.31 
 
 
659 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4021  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.28 
 
 
659 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000531805  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0231  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.43 
 
 
659 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0234  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.12 
 
 
659 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000102489  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0231  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.28 
 
 
659 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0266  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.88 
 
 
659 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3724  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.54 
 
 
659 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00953615  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0218  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.06 
 
 
659 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000250074  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1687  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.02 
 
 
666 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1035  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.49 
 
 
679 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1209  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.05 
 
 
679 aa  475  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2669  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.67 
 
 
663 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0234  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.69 
 
 
659 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466209  unclonable  0.0000000000673434 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0229  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.69 
 
 
659 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0413329  hitchhiker  0.00683756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0234  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.69 
 
 
659 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0552796  unclonable  0.0000000000976147 
 
 
-
 
NC_004310  BR0609  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40 
 
 
663 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0608  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40 
 
 
663 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0182  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.28 
 
 
656 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00179413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  43.15 
 
 
664 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3411  cytochrome c-type biogenesis protein CycK  39.94 
 
 
664 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276994  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2390  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.11 
 
 
653 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175562  hitchhiker  0.0000318804 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3977  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.09 
 
 
653 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0556794  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3775  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.88 
 
 
666 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0802  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.97 
 
 
649 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.73075  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4770  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.55 
 
 
673 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4051  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.88 
 
 
666 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.663155  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1743  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.02 
 
 
681 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.262796  normal  0.222748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1364  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.35 
 
 
667 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2786  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.74 
 
 
657 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.8 
 
 
661 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.018137  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2152  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.52 
 
 
662 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03069  Cytochrome c biogenesis factor  38.48 
 
 
685 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0418  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.85 
 
 
657 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1640  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.9 
 
 
651 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0476911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0943  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.57 
 
 
661 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1507  cytochrome c assembly protein  39.97 
 
 
685 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0374  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.63 
 
 
692 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720361 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1348  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.58 
 
 
682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.51 
 
 
677 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0398  cytochrome c-type biogenesis protein F  38.6 
 
 
649 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1549  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.15 
 
 
660 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0923  cytochrome C-type biogenesis protein CcmF  40.43 
 
 
650 aa  445  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0892  cytochrome C-type biogenesis protein CcmF  40.49 
 
 
650 aa  445  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1454  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.69 
 
 
647 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.494014  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2446  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.13 
 
 
672 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4056  cytochrome c-type heme lyase CcmF  42.25 
 
 
680 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3351  cytochrome c assembly protein  37.87 
 
 
889 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239047  normal  0.352228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02123  heme lyase, CcmF subunit  39.78 
 
 
647 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1463  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.78 
 
 
647 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.617817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3630  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.31 
 
 
657 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3388  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.28 
 
 
657 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609216  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0035  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.17 
 
 
671 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.836519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02082  hypothetical protein  39.78 
 
 
647 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2003  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.42 
 
 
660 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.151037  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2334  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.54 
 
 
647 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2344  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.78 
 
 
647 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.756913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0941  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.51 
 
 
660 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.983495  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1211  cytochrome c-type biogenesis protein (CcmF)  41.58 
 
 
661 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3333  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.94 
 
 
647 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2132  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.11 
 
 
660 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3999  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.47 
 
 
658 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.509835  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0745  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.54 
 
 
647 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202682  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2852  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.82 
 
 
672 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2495  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.54 
 
 
647 aa  438  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1871  cytochrome C-type biogenesis protein CcmF  38.75 
 
 
675 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0677969  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2276  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.62 
 
 
652 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0922  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.97 
 
 
662 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0606088  normal  0.0314376 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1169  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.71 
 
 
656 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3847  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.96 
 
 
657 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1561  cytochrome c-type biogenesis protein  38.12 
 
 
681 aa  435  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77201  normal  0.310028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1193  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.08 
 
 
661 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.157027  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1582  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.05 
 
 
662 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0635  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.27 
 
 
660 aa  435  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181407  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3410  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.58 
 
 
645 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3448  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.85 
 
 
660 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186269  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1411  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.81 
 
 
694 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1439  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.02 
 
 
660 aa  435  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0390  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.74 
 
 
656 aa  432  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.458476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1071  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.21 
 
 
665 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.998298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0585  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.15 
 
 
665 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971305  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1836  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.21 
 
 
660 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0373548  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3207  cytochrome c assembly protein  40.87 
 
 
676 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002846  cytochrome c heme lyase subunit CcmF  38.1 
 
 
658 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1392  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.74 
 
 
656 aa  432  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1501  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.74 
 
 
656 aa  432  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.175478  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1406  cytochrome c assembly protein  39.85 
 
 
666 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.419457  normal  0.0330583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1127  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.57 
 
 
654 aa  428  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1401  cytochrome c assembly protein  39.42 
 
 
666 aa  429  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0545424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.86 
 
 
666 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108903 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3019  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.92 
 
 
653 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1681  cytochrome c assembly protein  39.69 
 
 
666 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0360404  normal  0.640994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3648  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.16 
 
 
662 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>