More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1507 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1507  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
685 aa  1365    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3351  cytochrome c assembly protein  39.74 
 
 
889 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239047  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3502  cytochrome c assembly protein  40.29 
 
 
654 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3207  cytochrome c assembly protein  41.01 
 
 
676 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4478  cytochrome c assembly protein  38.9 
 
 
733 aa  452  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1958  cytochrome c assembly protein  38.79 
 
 
658 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1209  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.78 
 
 
679 aa  362  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0040  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.93 
 
 
657 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1802  cytochrome c assembly protein  34.23 
 
 
640 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0939  cytochrome c assembly protein  35.4 
 
 
671 aa  352  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0935007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2152  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.28 
 
 
662 aa  347  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1364  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.97 
 
 
667 aa  343  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3977  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.63 
 
 
653 aa  341  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0556794  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0035  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.73 
 
 
671 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.836519  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4051  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.08 
 
 
666 aa  339  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.663155  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3775  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.08 
 
 
666 aa  339  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.61 
 
 
666 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108903 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1513  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.75 
 
 
639 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3566  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.59 
 
 
660 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0145214  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1687  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.51 
 
 
666 aa  336  7e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0609  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.14 
 
 
663 aa  332  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4770  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.09 
 
 
673 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0608  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.14 
 
 
663 aa  332  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1836  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.52 
 
 
660 aa  332  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0373548  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0218  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.38 
 
 
659 aa  330  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000250074  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2132  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.44 
 
 
660 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2003  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.7 
 
 
660 aa  330  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.151037  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0248  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.86 
 
 
658 aa  329  8e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00203639  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1378  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.93 
 
 
639 aa  329  9e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2669  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.84 
 
 
663 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0922  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.22 
 
 
662 aa  328  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0606088  normal  0.0314376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0982  cytochrome c assembly protein  34.83 
 
 
633 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0263882  hitchhiker  0.000647846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4021  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.12 
 
 
659 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000531805  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0234  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.23 
 
 
659 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000102489  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0231  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.23 
 
 
659 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0231  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.23 
 
 
659 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3724  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.23 
 
 
659 aa  325  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00953615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.29 
 
 
661 aa  325  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.018137  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3448  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.93 
 
 
660 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186269  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4166  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.48 
 
 
664 aa  324  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522629  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0802  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.43 
 
 
649 aa  324  3e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.73075  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0840  cytochrome c assembly protein  33.77 
 
 
663 aa  324  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1247  cytochrome c assembly protein  35.53 
 
 
660 aa  323  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.65063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3411  cytochrome c-type biogenesis protein CycK  34.85 
 
 
664 aa  323  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276994  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2446  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.81 
 
 
672 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2232  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.75 
 
 
660 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1640  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.41 
 
 
651 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0476911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1169  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.55 
 
 
656 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0234  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.65 
 
 
659 aa  321  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0552796  unclonable  0.0000000000976147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4656  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.07 
 
 
659 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724675  hitchhiker  0.00321654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1401  cytochrome c assembly protein  33.95 
 
 
666 aa  320  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0545424 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0193  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.81 
 
 
658 aa  320  7e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000108567  normal  0.0553743 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0266  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.65 
 
 
659 aa  319  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0941  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.74 
 
 
660 aa  319  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.983495  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2852  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.89 
 
 
672 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0943  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.67 
 
 
661 aa  318  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190679  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0229  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.49 
 
 
659 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0413329  hitchhiker  0.00683756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0182  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.76 
 
 
656 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00179413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1659  cytochrome c assembly protein  34.75 
 
 
659 aa  318  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118924  normal  0.550296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1071  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.94 
 
 
665 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.998298 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0234  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.33 
 
 
659 aa  318  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466209  unclonable  0.0000000000673434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4284  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.81 
 
 
659 aa  317  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184466 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1127  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.56 
 
 
654 aa  317  7e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2508  cytochrome c assembly protein  33.72 
 
 
627 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2854  cytochrome c assembly protein  33.44 
 
 
657 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1193  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.62 
 
 
661 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.157027  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1439  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.28 
 
 
660 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2786  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.38 
 
 
657 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2390  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.37 
 
 
653 aa  313  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175562  hitchhiker  0.0000318804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4431  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.03 
 
 
660 aa  313  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.938091  normal  0.729062 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1477  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.96 
 
 
641 aa  312  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0046399  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1406  cytochrome c assembly protein  33.56 
 
 
666 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.419457  normal  0.0330583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3990  cytochrome c assembly protein  34 
 
 
641 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.186912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1681  cytochrome c assembly protein  33.56 
 
 
666 aa  312  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0360404  normal  0.640994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3891  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.68 
 
 
658 aa  311  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109986  normal  0.46196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.83 
 
 
664 aa  311  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3073  cytochrome c-type biogenesis protein cycK  35.38 
 
 
659 aa  310  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.46047  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2633  cytochrome c maturation protein, CcmF  34.12 
 
 
656 aa  309  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0466385  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1290  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.12 
 
 
656 aa  309  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.595992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03069  Cytochrome c biogenesis factor  33.59 
 
 
685 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1955  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.82 
 
 
665 aa  306  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1348  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.43 
 
 
682 aa  306  8.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002846  cytochrome c heme lyase subunit CcmF  32.47 
 
 
658 aa  306  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0374  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.05 
 
 
692 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720361 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1743  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.82 
 
 
681 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.262796  normal  0.222748 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4056  cytochrome c-type heme lyase CcmF  34.44 
 
 
680 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2276  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31 
 
 
652 aa  303  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1411  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.54 
 
 
694 aa  301  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3019  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.53 
 
 
653 aa  301  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0438  cytochrome c assembly protein  32.76 
 
 
660 aa  301  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03130  hypothetical protein  32.02 
 
 
660 aa  300  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1871  cytochrome C-type biogenesis protein CcmF  31.6 
 
 
675 aa  299  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0677969  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0398  cytochrome c-type biogenesis protein F  32.18 
 
 
649 aa  299  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1211  cytochrome c-type biogenesis protein (CcmF)  34.66 
 
 
661 aa  298  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3648  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.1 
 
 
662 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.6 
 
 
677 aa  297  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2932  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.61 
 
 
659 aa  296  7e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.310329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1582  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.21 
 
 
662 aa  296  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0432  cytochrome c-type biogenesis protein CycK  31.32 
 
 
659 aa  294  3e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0635  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.24 
 
 
660 aa  293  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>