More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0432 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3073  cytochrome c-type biogenesis protein cycK  53.02 
 
 
659 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.46047  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0609  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  55.15 
 
 
663 aa  712    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0922  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  54.11 
 
 
662 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0606088  normal  0.0314376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1364  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  55.69 
 
 
667 aa  715    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1193  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  52.21 
 
 
661 aa  646    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.157027  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0608  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  55.15 
 
 
663 aa  713    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2669  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  56.21 
 
 
663 aa  721    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0635  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  55.61 
 
 
660 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181407  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3448  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  54.57 
 
 
660 aa  673    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186269  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1071  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  54 
 
 
665 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.998298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1836  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  53.2 
 
 
660 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0373548  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2003  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  53.33 
 
 
660 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.151037  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1439  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  53.18 
 
 
660 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612264  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0899  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  54.46 
 
 
662 aa  643    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160202  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2132  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  53.33 
 
 
660 aa  660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0432  cytochrome c-type biogenesis protein CycK  100 
 
 
659 aa  1315    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  52.4 
 
 
661 aa  661    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.018137  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  49.24 
 
 
666 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108903 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2232  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  49.84 
 
 
660 aa  600  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1406  cytochrome c assembly protein  48.69 
 
 
666 aa  592  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.419457  normal  0.0330583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0438  cytochrome c assembly protein  49 
 
 
660 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4166  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  50 
 
 
664 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522629  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1401  cytochrome c assembly protein  48.39 
 
 
666 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0545424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1681  cytochrome c assembly protein  48.69 
 
 
666 aa  591  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0360404  normal  0.640994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4431  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  49.85 
 
 
660 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.938091  normal  0.729062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3411  cytochrome c-type biogenesis protein CycK  45.92 
 
 
664 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276994  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0035  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  47.26 
 
 
671 aa  569  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.836519  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3977  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  46.01 
 
 
653 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0556794  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0941  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  46.98 
 
 
660 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.983495  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3891  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.17 
 
 
658 aa  554  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109986  normal  0.46196 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3775  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.8 
 
 
666 aa  547  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4051  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.8 
 
 
666 aa  547  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.663155  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1169  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  46.54 
 
 
656 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2152  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.99 
 
 
662 aa  534  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2854  cytochrome c assembly protein  43.25 
 
 
657 aa  522  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1127  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44 
 
 
654 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1659  cytochrome c assembly protein  42.7 
 
 
659 aa  518  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118924  normal  0.550296 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1640  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  43.73 
 
 
651 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0476911  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1209  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.89 
 
 
679 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2932  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.26 
 
 
659 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.310329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2633  cytochrome c maturation protein, CcmF  46.79 
 
 
656 aa  505  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0466385  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1290  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  46.79 
 
 
656 aa  505  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.595992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0040  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.07 
 
 
657 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4770  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  43.63 
 
 
673 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3990  cytochrome c assembly protein  43.98 
 
 
641 aa  495  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.186912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3999  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.79 
 
 
658 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.509835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2786  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.92 
 
 
657 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2446  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.79 
 
 
672 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1513  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.51 
 
 
639 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2276  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.2 
 
 
652 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0398  cytochrome c-type biogenesis protein F  41.13 
 
 
649 aa  484  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0248  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.87 
 
 
658 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00203639  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2852  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.64 
 
 
672 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1378  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.18 
 
 
639 aa  481  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3019  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.74 
 
 
653 aa  480  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0218  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.36 
 
 
659 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000250074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0390  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.25 
 
 
656 aa  478  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.458476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03069  Cytochrome c biogenesis factor  41.05 
 
 
685 aa  477  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1501  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.09 
 
 
656 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.175478  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4056  cytochrome c-type heme lyase CcmF  43.44 
 
 
680 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0234  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.99 
 
 
659 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000102489  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1392  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.09 
 
 
656 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002846  cytochrome c heme lyase subunit CcmF  41.36 
 
 
658 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4021  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.86 
 
 
659 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000531805  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0231  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.83 
 
 
659 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0943  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.32 
 
 
661 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190679  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0374  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.48 
 
 
692 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720361 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03130  hypothetical protein  40.72 
 
 
660 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0234  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.63 
 
 
659 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466209  unclonable  0.0000000000673434 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0229  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.63 
 
 
659 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0413329  hitchhiker  0.00683756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2419  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.44 
 
 
651 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3724  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.85 
 
 
659 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00953615  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0234  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.29 
 
 
659 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0552796  unclonable  0.0000000000976147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0231  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.68 
 
 
659 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4656  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.44 
 
 
659 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724675  hitchhiker  0.00321654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0193  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.55 
 
 
658 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000108567  normal  0.0553743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3566  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.97 
 
 
660 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0145214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.97 
 
 
677 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2723  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.83 
 
 
651 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1549  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.43 
 
 
660 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4284  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.97 
 
 
659 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184466 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0266  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.55 
 
 
659 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0182  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.89 
 
 
656 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00179413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3386  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.04 
 
 
656 aa  465  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1516  cytochrome c assembly protein  42.58 
 
 
656 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.658808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0418  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40 
 
 
657 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1211  cytochrome c-type biogenesis protein (CcmF)  41.28 
 
 
661 aa  459  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1411  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.1 
 
 
694 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02123  heme lyase, CcmF subunit  38.8 
 
 
647 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2344  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.8 
 
 
647 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.756913 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1463  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.8 
 
 
647 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.617817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3333  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.65 
 
 
647 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.97 
 
 
664 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0585  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.27 
 
 
665 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971305  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30400  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.91 
 
 
657 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02082  hypothetical protein  38.8 
 
 
647 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0802  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.12 
 
 
649 aa  449  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.73075  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4204  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.71 
 
 
643 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2384  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.71 
 
 
643 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2592  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  40.71 
 
 
643 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.233075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>