More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0618 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  100 
 
 		 234 aa  473  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  95.73 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  95.3 
 
 		 254 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  81.66 
 
 		 234 aa  378  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  62.88 
 
 		 231 aa  306  3e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.02 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  40.25 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.04 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  34.76 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  37.39 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.92 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  33.91 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.61 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  34.36 
 
 		 248 aa  121  9e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.91 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.48 
 
 		 254 aa  118  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.84 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.76 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.76 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  39.87 
 
 		 228 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.69 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  39.87 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11611  tRNA/rRNA methyltransferase  35.68 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.59 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  39.62 
 
 		 249 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.93 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11471  tRNA/rRNA methyltransferase  33.62 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  31.22 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29 
 
 		 263 aa  104  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.61 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  31.74 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  30 
 
 		 308 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0716  tRNA/rRNA methyltransferase  35.67 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  30 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.75 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.74 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0571  putative RNA methyltransferase  37.42 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.918985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  29.11 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.8 
 
 		 276 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5917  putative RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.579463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04244  hypothetical protein  35.48 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04279  predicted rRNA methyltransferase  35.48 
 
 		 228 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.8 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5002  putative RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.985383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4639  putative RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3654  putative RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.749587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3595  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.84 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.31 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  27.92 
 
 		 274 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11621  tRNA/rRNA methyltransferase  37.66 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  34.39 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.47 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  29.03 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0532  putative RNA methyltransferase  36.42 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.47 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  35 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 291 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.51 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0563  putative RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  29.66 
 
 		 244 aa  96.3  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 281 aa  96.3  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0441  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.64 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  30.8 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  36.6 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  28.4 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  28.63 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0066  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.18 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0596195  hitchhiker  0.0096121 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  28.63 
 
 		 263 aa  95.5  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.44 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.44 
 
 		 243 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5013  putative RNA methyltransferase  33.55 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129781  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1803  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.57 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2433  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.43 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5009  putative RNA methyltransferase  33.55 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.38 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  31.95 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  36.18 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.21 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  29.17 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  34.21 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4923  putative RNA methyltransferase  33.55 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000405999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.62 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4957  putative RNA methyltransferase  32.9 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.914631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1949  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.22 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  26.05 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.66 
 
 		 245 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  27.78 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  33.12 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  28.1 
 
 		 275 aa  92  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.38 
 
 		 399 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  27.19 
 
 		 252 aa  92  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15301  tRNA/rRNA methyltransferase  37.01 
 
 		 245 aa  92  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.877523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.24 
 
 		 279 aa  91.7  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  28.26 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>