297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2433 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  60.43 
 
 
243 aa  311  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  48.25 
 
 
249 aa  231  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  46.22 
 
 
251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  48.68 
 
 
243 aa  219  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  44.93 
 
 
261 aa  218  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  44.49 
 
 
248 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  43.42 
 
 
232 aa  208  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.59 
 
 
235 aa  184  8e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.24 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  40.87 
 
 
231 aa  155  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.02 
 
 
263 aa  153  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.3 
 
 
255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  39.91 
 
 
234 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.86 
 
 
241 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  40.44 
 
 
234 aa  150  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  39.04 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  39.47 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  38.2 
 
 
255 aa  141  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.84 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.13 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  39.39 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  35.39 
 
 
241 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.29 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  35.39 
 
 
241 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.06 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.29 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  34.54 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.5 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  34.98 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  36.55 
 
 
245 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.55 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  34.54 
 
 
251 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  35.34 
 
 
245 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  34.55 
 
 
279 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0715  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  36.55 
 
 
242 aa  128  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  34.16 
 
 
241 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  34.58 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  35.37 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.52 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  34.69 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.71 
 
 
245 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.87 
 
 
245 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  33.47 
 
 
239 aa  125  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.97 
 
 
253 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.3 
 
 
241 aa  124  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  32.4 
 
 
287 aa  124  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.71 
 
 
241 aa  124  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  34.41 
 
 
257 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  33.2 
 
 
262 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  31.78 
 
 
257 aa  124  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  34.87 
 
 
247 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  34.87 
 
 
257 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.26 
 
 
258 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  34.01 
 
 
308 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  32.92 
 
 
257 aa  121  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  34.84 
 
 
240 aa  121  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  37.66 
 
 
248 aa  121  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.68 
 
 
257 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.86 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  32.94 
 
 
254 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  33.2 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  32.5 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  32.37 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  32.5 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  32.54 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.5 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.2 
 
 
256 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  32.5 
 
 
242 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  34.98 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15301  tRNA/rRNA methyltransferase  36.25 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.877523  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  32.64 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  36.1 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11611  tRNA/rRNA methyltransferase  34.47 
 
 
250 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  34.96 
 
 
240 aa  118  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.8 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.39 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  30.17 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  33.75 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.06 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  35.65 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  32.79 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  31.3 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  32 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  32 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  32 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.54 
 
 
245 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  32 
 
 
243 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.4 
 
 
274 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.88 
 
 
289 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  32.54 
 
 
245 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  33.88 
 
 
289 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  32.54 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.54 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  32.54 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.54 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  32.54 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  32.54 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  33.33 
 
 
263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  32.54 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>