271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1301 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  100 
 
 		 249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  65.07 
 
 		 261 aa  330  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  64.66 
 
 		 232 aa  329  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  63.45 
 
 		 248 aa  317  9e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  62.2 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  50.45 
 
 		 243 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  48.25 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  40.24 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.15 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.7 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.24 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.52 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  36.89 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  34.21 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  34.2 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.38 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  35.22 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.18 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.99 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  32.61 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  33.04 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  33.04 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  36.86 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.73 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  36.75 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.77 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.53 
 
 		 398 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  35.6 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.34 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.77 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.65 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.17 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  34.71 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  32.53 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  31.43 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.48 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  35.95 
 
 		 245 aa  112  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.08 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.76 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  33.07 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  33.07 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  34.63 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  34.17 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  33.07 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.13 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.33 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.78 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  34 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  34.75 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  31.78 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1738  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.06 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  31.78 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  32.68 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.05 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  34.4 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  34.98 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  34.98 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  34.98 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.98 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  33.33 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  34.27 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  34.29 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2187  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.37 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.2 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.47 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  31.05 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  32.77 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.02 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  32.62 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.47 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.74 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  31.16 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  34.27 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.98 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.89 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.32 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.56 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  31.78 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.41 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  32.17 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  34.87 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.45 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  33.47 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  31.06 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1245  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  32.14 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.8 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  31.92 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.62 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2433  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.22 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  32.38 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.05 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>