279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0545 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  100 
 
 		 257 aa  527  1e-149  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.89 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  31.36 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.78 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  32.89 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.3 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.33 
 
 		 235 aa  122  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  34.22 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  33.2 
 
 		 276 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  33.2 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  31.49 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.76 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  31.45 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.98 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1803  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.71 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  36.42 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  32.81 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  32.41 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.74 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  32.76 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0066  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.68 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0596195  hitchhiker  0.0096121 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  30.3 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  32.74 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  32.3 
 
 		 241 aa  99.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.74 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  33.19 
 
 		 246 aa  98.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  31.74 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  32.3 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  32.3 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  32.47 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.57 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  31.36 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  31.47 
 
 		 251 aa  95.5  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  33.06 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  30.45 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  32.75 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  35.53 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.75 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  31.09 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.9 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  32.75 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  31.36 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  31.2 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  36.18 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.6 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.1 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  28.91 
 
 		 286 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  29.49 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  29.1 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.27 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.93 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  32.75 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  32.3 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.17 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  28.95 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.43 
 
 		 237 aa  92  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.06 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.86 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  29.06 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  29.06 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  30.74 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  29.06 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.06 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  29.06 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.43 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  29.06 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  29.06 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.8 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.06 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  27.16 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.85 
 
 		 399 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.61 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.05 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.06 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  32 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.57 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  30.09 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  29.18 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  27.82 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  28.63 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  28.88 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  28.63 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.54 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  28.63 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  27.16 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.46 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.16 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  29.69 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.99 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  28.21 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  30.09 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  29.74 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2746  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.18 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.504131  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  28.27 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>