More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1803 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1803  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0066  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.95 
 
 		 231 aa  300  1e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0596195  hitchhiker  0.0096121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.69 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11611  tRNA/rRNA methyltransferase  43.95 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11621  tRNA/rRNA methyltransferase  37.17 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.96 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0673  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.05 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000736147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.47 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  38.27 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.7 
 
 		 253 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.13 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.05 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  31.43 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  31.84 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.84 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  31.84 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.84 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  38.27 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.84 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  31.84 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  31.84 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  31.84 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  31.43 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  31.43 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  31.84 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  31.43 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0716  tRNA/rRNA methyltransferase  37.78 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  31.02 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15301  tRNA/rRNA methyltransferase  39.78 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.877523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.13 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.33 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.45 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  38.22 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  38.71 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.91 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  31.02 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  36.77 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  35.29 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  30.77 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  40.26 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.38 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  36.56 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  30.92 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  31.33 
 
 		 261 aa  101  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11471  tRNA/rRNA methyltransferase  36.94 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  31.02 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.33 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.91 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  37.91 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.91 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.89 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.84 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.75 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  37.58 
 
 		 248 aa  98.6  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  36.13 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  29.96 
 
 		 308 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  29.17 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.8 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.67 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  29.03 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  35.4 
 
 		 287 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  31.43 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.96 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  29.8 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  29.57 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 254 aa  95.9  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0715  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  38.12 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  38.12 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  28.51 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  38.06 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  38.06 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  27.73 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  36.25 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  36.25 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  36.25 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 251 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  36.25 
 
 		 241 aa  95.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  29.37 
 
 		 251 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  38.12 
 
 		 254 aa  95.1  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1949  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.25 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.6 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  30.67 
 
 		 289 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  31.3 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5013  putative RNA methyltransferase  29.44 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  29.57 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  33.54 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  34.57 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  29.13 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.81 
 
 		 289 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  28.81 
 
 		 289 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5009  putative RNA methyltransferase  29.44 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2688  RNA methyltransferase  28.15 
 
 		 346 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2604  RNA methyltransferase  28.15 
 
 		 311 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>