284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0071 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  63.76 
 
 
234 aa  310  1e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  65.07 
 
 
234 aa  309  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  62.88 
 
 
254 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  62.88 
 
 
234 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.26 
 
 
235 aa  170  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  38.66 
 
 
243 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.87 
 
 
231 aa  155  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  36.32 
 
 
243 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  36.84 
 
 
232 aa  138  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.21 
 
 
249 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  35.65 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.06 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  33.77 
 
 
248 aa  129  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.67 
 
 
251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.25 
 
 
254 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.58 
 
 
241 aa  122  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.84 
 
 
290 aa  118  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0441  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.12 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.78 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.24 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  29.24 
 
 
245 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.31 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  29.96 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.12 
 
 
255 aa  109  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04279  predicted rRNA methyltransferase  36.13 
 
 
228 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  37.58 
 
 
255 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.42 
 
 
245 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5917  putative RNA methyltransferase  36.13 
 
 
228 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.579463  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04244  hypothetical protein  36.13 
 
 
229 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  35.48 
 
 
228 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  37.75 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  28.69 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4639  putative RNA methyltransferase  36.13 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3654  putative RNA methyltransferase  36.13 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.749587  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5002  putative RNA methyltransferase  36.13 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.985383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3595  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.48 
 
 
228 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  39.62 
 
 
228 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0563  putative RNA methyltransferase  34.04 
 
 
228 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  30.96 
 
 
244 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.16 
 
 
245 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  36.13 
 
 
228 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  31.17 
 
 
257 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  37.89 
 
 
260 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.43 
 
 
258 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  33.05 
 
 
240 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  31.65 
 
 
228 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0974  RNA methyltransferase  28.02 
 
 
253 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.75 
 
 
266 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11611  tRNA/rRNA methyltransferase  39.87 
 
 
250 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0066  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.61 
 
 
231 aa  105  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0596195  hitchhiker  0.0096121 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  31.36 
 
 
239 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.15 
 
 
264 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  31.17 
 
 
308 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2084  RNA methyltransferase  36.41 
 
 
251 aa  104  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0672832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  29.71 
 
 
257 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  30.26 
 
 
251 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  35.4 
 
 
267 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5013  putative RNA methyltransferase  34.19 
 
 
228 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129781  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  28.02 
 
 
262 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.84 
 
 
274 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5009  putative RNA methyltransferase  34.19 
 
 
228 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  28.98 
 
 
262 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11621  tRNA/rRNA methyltransferase  36.72 
 
 
250 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640948  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  26.34 
 
 
246 aa  101  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4923  putative RNA methyltransferase  34.19 
 
 
228 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000405999  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0716  tRNA/rRNA methyltransferase  34.36 
 
 
253 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  30.04 
 
 
257 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1803  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.91 
 
 
237 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4957  putative RNA methyltransferase  33.55 
 
 
228 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.914631  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0532  putative RNA methyltransferase  32.09 
 
 
233 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11471  tRNA/rRNA methyltransferase  38.06 
 
 
236 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2281  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.76 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  24.69 
 
 
255 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  26.81 
 
 
248 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  28.99 
 
 
251 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  27.54 
 
 
263 aa  99.4  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  32.5 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  29.83 
 
 
241 aa  99.4  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  28.99 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  28.99 
 
 
279 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  32.08 
 
 
248 aa  99  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  27.04 
 
 
275 aa  98.6  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  28.75 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  27.12 
 
 
263 aa  98.2  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.15 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  28.99 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.27 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  30 
 
 
261 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  26.25 
 
 
250 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  30.17 
 
 
281 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3658  putative RNA methyltransferase  32.02 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  30.08 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15301  tRNA/rRNA methyltransferase  40.51 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.877523  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.45 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.13 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.3 
 
 
276 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1243  RNA methyltransferase  31.1 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108942  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  31.87 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  28.29 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>