More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2399 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  100 
 
 		 243 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  99.18 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  69.83 
 
 		 253 aa  327  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  63.33 
 
 		 248 aa  298  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  61.63 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  56.85 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  56.91 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  47.9 
 
 		 245 aa  205  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15301  tRNA/rRNA methyltransferase  42.74 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.877523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  41.53 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  43.8 
 
 		 249 aa  188  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  42.74 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1949  RNA methyltransferase TrmH, group 1  45.06 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.86 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11611  tRNA/rRNA methyltransferase  37.45 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11621  tRNA/rRNA methyltransferase  36.63 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  38.91 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11471  tRNA/rRNA methyltransferase  36.6 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  38.68 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0716  tRNA/rRNA methyltransferase  41.67 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  38.27 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  37.86 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.06 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.6 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.2 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.8 
 
 		 253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.89 
 
 		 258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.06 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.6 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  37.96 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  37.96 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.6 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  37.96 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.64 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.64 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  39.6 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  38.56 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  39.2 
 
 		 257 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  37.55 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.39 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  38.43 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  38.4 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  37.71 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  38.79 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  36.36 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  39.08 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.04 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.09 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.55 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  36.63 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  39.29 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.29 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.29 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.29 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  39.29 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  38.46 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  36.86 
 
 		 241 aa  142  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0673  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.97 
 
 		 267 aa  141  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000736147  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 243 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 243 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 243 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  37.29 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  37.04 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  38.65 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  38.89 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.03 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.2 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  38.66 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  37.87 
 
 		 242 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.87 
 
 		 242 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  37.87 
 
 		 242 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.71 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  39.51 
 
 		 289 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  37.87 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  37.55 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  37.55 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  37.55 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.09 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  39.09 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  36.97 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  37.05 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  34.27 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  37.34 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1620  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.49 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2552  RNA methyltransferase  38.43 
 
 		 303 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2167  RNA methyltransferase  38.43 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1663  RNA methyltransferase  38.43 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.09 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3150  RNA methyltransferase  38.43 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  35.8 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1440  RNA methyltransferase  38.43 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>