More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11471 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_11471  tRNA/rRNA methyltransferase  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 1  69.49 
 
 		 249 aa  342  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11611  tRNA/rRNA methyltransferase  69.92 
 
 		 250 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11621  tRNA/rRNA methyltransferase  68.64 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  40.6 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  44.02 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.2 
 
 		 245 aa  201  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15301  tRNA/rRNA methyltransferase  41.2 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.877523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1949  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.43 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.75 
 
 		 243 aa  177  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  38.33 
 
 		 245 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0716  tRNA/rRNA methyltransferase  33.73 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.07 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.91 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.44 
 
 		 245 aa  161  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.6 
 
 		 243 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.6 
 
 		 243 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  31.91 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.06 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  32.91 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.06 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  27.12 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  29.29 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.47 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  29.36 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.46 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  26.38 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  30.33 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0066  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.22 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0596195  hitchhiker  0.0096121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1155  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.02 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043355 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  30.74 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.17 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  30.77 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  33.62 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  27.51 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  28.63 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  29.11 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.58 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  32 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  28.32 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  29.75 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.1 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0974  RNA methyltransferase  32.61 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  30.25 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  29.11 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.07 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  29.11 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  33.04 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1803  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.94 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  30.83 
 
 		 276 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  29.31 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.54 
 
 		 268 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  29.61 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  31.06 
 
 		 291 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  28.95 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  28.21 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  38.06 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  28.94 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  28.7 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  28.7 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.7 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  28.63 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  26.92 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.63 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0941  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.33 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  28.51 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  29.18 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.39 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.69 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  28.7 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 251 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  27.97 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  30.09 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.78 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.78 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  25.33 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  28.99 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  28.27 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2187  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29 
 
 		 271 aa  95.5  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  25.75 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  28.69 
 
 		 267 aa  95.1  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  27.88 
 
 		 240 aa  95.1  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.76 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  27.76 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0463  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.74203  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  27.94 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.94 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  27.85 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.03 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  27.94 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  28.87 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.94 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  27.94 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  27.94 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  27.94 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  26.29 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>