More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0974 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0974  RNA methyltransferase  100 
 
 		 253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0569  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.87 
 
 		 254 aa  311  9e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1155  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  61.48 
 
 		 266 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043355 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0441  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  53.09 
 
 		 248 aa  284  9e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0463  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.61 
 
 		 256 aa  268  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.74203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0941  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.79 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  41.96 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  41.45 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  40.85 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.63 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  40.25 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.66 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  36.43 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  40 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  39.24 
 
 		 255 aa  141  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  39.75 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  35.27 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.74 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  38.49 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  35.32 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.6 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.78 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  38.06 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.74 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  35.41 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.74 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.34 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.18 
 
 		 254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  36.67 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  35.98 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.67 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  36.67 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  36.67 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  40.69 
 
 		 399 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  35.98 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2746  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.5 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.504131  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  36.82 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  33.2 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.75 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  34.41 
 
 		 286 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  35.23 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.82 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.03 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.77 
 
 		 410 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.24 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0827  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.76 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  35.16 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.34 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  34.41 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  36.86 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  37.29 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  38.02 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.71 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.73 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  34.71 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.08 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  36.29 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  33.59 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  34.18 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.96 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.29 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  36.29 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.62 
 
 		 399 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  32.49 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  33.86 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  36.21 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.94 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  36.44 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.8 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.63 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  36.9 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  34.85 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  35.47 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.68 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1935  RNA methyltransferase  38.56 
 
 		 338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  35.08 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  35.08 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  34.91 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  35.59 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  35.54 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2552  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1663  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1440  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2604  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3150  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2167  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2688  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 346 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  36.86 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  34.02 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.48 
 
 		 398 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  42.24 
 
 		 262 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  34.32 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  31.67 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.17 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>