More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4813 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  100 
 
 		 248 aa  493  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  89.88 
 
 		 250 aa  441  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  75.95 
 
 		 245 aa  360  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  74.04 
 
 		 245 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  73.19 
 
 		 245 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  72.34 
 
 		 261 aa  346  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.57 
 
 		 271 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.277848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  53.62 
 
 		 276 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  52.77 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  51.68 
 
 		 262 aa  238  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  51.9 
 
 		 399 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  52.77 
 
 		 276 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.16 
 
 		 398 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  53.59 
 
 		 399 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  53.16 
 
 		 276 aa  230  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0394  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.08 
 
 		 281 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  51.05 
 
 		 410 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4570  RNA methyltransferase  49.79 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0223529  normal  0.0756262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1738  RNA methyltransferase TrmH, group 1  52.74 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  50 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  50.21 
 
 		 276 aa  210  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  50.21 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  50.85 
 
 		 281 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1295  RNA methyltransferase TrmH, group 1  49.79 
 
 		 403 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  48.94 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  47.72 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.75 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1624  RNA methyltransferase TrmH, group 1  49.79 
 
 		 410 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  50.21 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.58 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.54 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  49.58 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  45.53 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2243  tRNA/rRNA methyltransferase  47.9 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1403  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.04 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  42.29 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2433  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.11 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0420  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.88 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674451  normal  0.0345812 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  46.09 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0788  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.67 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0987211  normal  0.0803398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.53 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  38.46 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  35.44 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.18 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  34.63 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0463  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.04 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.74203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1571  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2746  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.17 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.504131  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  38.62 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.33 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0827  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.66 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  34.65 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.61 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.68 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  34.21 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.89 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  34.26 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  37.07 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.74 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.05 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0974  RNA methyltransferase  34.63 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1219  RNA methyltransferase  35.32 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  35.62 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.58 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  35.06 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  35.06 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.19 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2187  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.08 
 
 		 271 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  34.35 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  33.04 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  33.07 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.19 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  34.5 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1381  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.18 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0754104  normal  0.0118595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  35.15 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1155  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.92 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  34.18 
 
 		 228 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.94 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  34.73 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  35.93 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.43 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  32.67 
 
 		 308 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1161  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  34.8 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  0.325888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2949  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.7 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  32.33 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  34.3 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.04 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  30.74 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.2 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  31.91 
 
 		 245 aa  109  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0941  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.88 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  33.88 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.62 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.39 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1046  RNA methyltransferase  30.5 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0448584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0964  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.5 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  34.7 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>