285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1571 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1571  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 258 aa  531  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  38.1 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  38.1 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  35.78 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.26 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  37.23 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  36.36 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  38.1 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  35.59 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  38.1 
 
 		 240 aa  148  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.91 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.21 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.25 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.25 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.5 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.18 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0673  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.03 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000736147  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.12 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.68 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.78 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  33.47 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  33.47 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.71 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.86 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.47 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.67 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  36.71 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.76 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  36.82 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  35.86 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  35.17 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1219  RNA methyltransferase  39.08 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.52 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  32.4 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.47 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  33.46 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1663  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 306 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2604  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 311 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2552  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1935  RNA methyltransferase  36.97 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  34.32 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  37.19 
 
 		 289 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  35.17 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2688  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 346 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3150  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.17 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  35.17 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  36.63 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1440  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2167  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.53 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  32.11 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  35.17 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  34.75 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.22 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  35.32 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2517  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.9 
 
 		 353 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  hitchhiker  0.00000580733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  34.48 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1620  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.29 
 
 		 278 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.298646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  34.04 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.04 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  34.04 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.04 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  32.07 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.76 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.04 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0275  RNA methyltransferase  34.18 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00988641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.17 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  34.33 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  34.19 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  32.9 
 
 		 239 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  34.19 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  34.19 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  34.98 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.95 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2840  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  38.17 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.261142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  33.6 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2891  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.95 
 
 		 286 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  34.29 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3292  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.55 
 
 		 268 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.911818  normal  0.434355 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  32.47 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  32.65 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1381  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.38 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0754104  normal  0.0118595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  33.98 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4249  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.5 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0580338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  36.36 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  34.75 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>