297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2517 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2517  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  100 
 
 		 353 aa  713    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  hitchhiker  0.00000580733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1620  RNA methyltransferase TrmH, group 1  91.73 
 
 		 278 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  79.46 
 
 		 276 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  79.3 
 
 		 273 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  78.68 
 
 		 289 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  78.93 
 
 		 289 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  78.93 
 
 		 289 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  78.52 
 
 		 273 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  79.07 
 
 		 289 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1440  RNA methyltransferase  78.74 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1663  RNA methyltransferase  78.74 
 
 		 306 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3150  RNA methyltransferase  78.74 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1935  RNA methyltransferase  80.24 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2167  RNA methyltransferase  78.74 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2604  RNA methyltransferase  78.74 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2552  RNA methyltransferase  78.74 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2688  RNA methyltransferase  79.13 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  77.91 
 
 		 289 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1116  RNA methyltransferase TrmH, group 1  60 
 
 		 314 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1079  RNA methyltransferase TrmH  57.35 
 
 		 289 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1161  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  60.4 
 
 		 287 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  0.325888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1002  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  56.6 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122177  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1096  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  58.8 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0964  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  45.19 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301761  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1046  RNA methyltransferase  46.21 
 
 		 264 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0448584 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  50.19 
 
 		 256 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  48.98 
 
 		 251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  49.39 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  48.37 
 
 		 264 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  48.57 
 
 		 257 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  48.84 
 
 		 279 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  50.41 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  48.18 
 
 		 262 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  50 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1219  RNA methyltransferase  49.59 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  47.77 
 
 		 258 aa  206  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  49.59 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0985  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.2 
 
 		 250 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.223489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  43.78 
 
 		 257 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  43.78 
 
 		 257 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  47.11 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  47.33 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0827  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  46.94 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0853  RNA methyltransferase  46.99 
 
 		 250 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  45.78 
 
 		 254 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  46.28 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0673  RNA methyltransferase TrmH, group 1  46.72 
 
 		 267 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000736147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  42.08 
 
 		 254 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  42.91 
 
 		 259 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3565  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  47.95 
 
 		 243 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4249  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.74 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0580338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  42.86 
 
 		 254 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  47.41 
 
 		 240 aa  192  8e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  42.13 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  46.8 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  42.58 
 
 		 242 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  42.58 
 
 		 242 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2310  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.46 
 
 		 275 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  42.58 
 
 		 242 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  42.58 
 
 		 242 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1381  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.75 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0754104  normal  0.0118595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  41.09 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2891  RNA methyltransferase TrmH, group 1  43.21 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  41.41 
 
 		 240 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  41.73 
 
 		 257 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  41.73 
 
 		 257 aa  186  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  41.73 
 
 		 257 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  43.5 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.37 
 
 		 244 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2062  tRNA/rRNA methyltransferase, TrmH family, group 1  49.79 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  39.31 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  41.53 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  40.62 
 
 		 244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  41.9 
 
 		 245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  41.9 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.9 
 
 		 245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.63 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  41.9 
 
 		 246 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.9 
 
 		 246 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  41.9 
 
 		 246 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.22 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  41.9 
 
 		 246 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  41.9 
 
 		 246 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.9 
 
 		 246 aa  184  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  40.86 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  40.47 
 
 		 243 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  41.13 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.47 
 
 		 249 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  40.47 
 
 		 243 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  39.92 
 
 		 241 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  40.47 
 
 		 243 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  39.92 
 
 		 241 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  39.92 
 
 		 241 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3292  RNA methyltransferase TrmH, group 1  42.69 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.911818  normal  0.434355 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  40.08 
 
 		 243 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  42.54 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2075  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.97 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0447009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  40.98 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2746  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  46.72 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.504131  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  41.57 
 
 		 240 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>