299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1268 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  100 
 
 
262 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  68.32 
 
 
276 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  68.32 
 
 
276 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  66.03 
 
 
276 aa  348  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  65.27 
 
 
286 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  66.54 
 
 
281 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  65.78 
 
 
291 aa  342  2.9999999999999997e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  65.78 
 
 
276 aa  342  5e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  57.63 
 
 
275 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  50.94 
 
 
262 aa  251  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  51.79 
 
 
399 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.81 
 
 
398 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  50.2 
 
 
410 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  51.61 
 
 
399 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.19 
 
 
271 aa  228  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.277848  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.42 
 
 
253 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10914  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  52.08 
 
 
250 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1738  RNA methyltransferase TrmH, group 1  51.41 
 
 
397 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  50.8 
 
 
279 aa  222  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0394  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.6 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4570  RNA methyltransferase  45.16 
 
 
298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0223529  normal  0.0756262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  50.21 
 
 
261 aa  214  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  50 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  50.63 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1295  RNA methyltransferase TrmH, group 1  50 
 
 
403 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1624  RNA methyltransferase TrmH, group 1  49.6 
 
 
410 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  48.54 
 
 
245 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  48.33 
 
 
245 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1403  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.88 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0420  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.66 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674451  normal  0.0345812 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2243  tRNA/rRNA methyltransferase  47.11 
 
 
251 aa  195  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  45.16 
 
 
255 aa  194  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0788  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.86 
 
 
248 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0987211  normal  0.0803398 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  46.86 
 
 
246 aa  191  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.58 
 
 
243 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  46.58 
 
 
243 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  46.15 
 
 
243 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.26 
 
 
266 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2433  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.15 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  42.74 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.4 
 
 
249 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  35 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1571  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.98 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152101  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  36.19 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  37.25 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  36.03 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  35.8 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  37.25 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1245  RNA methyltransferase  37.4 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  38.3 
 
 
240 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  38.24 
 
 
240 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.1 
 
 
246 aa  122  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  38.14 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.14 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.14 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  38.14 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  35.22 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.14 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  38.14 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  36.99 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  38.14 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  35.83 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  38.14 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  38.14 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  36.99 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  36.99 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  36.1 
 
 
245 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.44 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  36.93 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  36.93 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  36.93 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.59 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  36.93 
 
 
243 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.47 
 
 
241 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  36.17 
 
 
239 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  36.93 
 
 
243 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.03 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  36.4 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  34.29 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.91 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  34.19 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.62 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  36.4 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.62 
 
 
241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.17 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  35.02 
 
 
240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  33.76 
 
 
257 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  34.73 
 
 
241 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  36.86 
 
 
244 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1161  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  38.08 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  0.325888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  35.17 
 
 
228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.87 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1002  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.91 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122177  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  34.29 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2187  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.7 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.92 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  34.73 
 
 
241 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  32.94 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  34.73 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  34.31 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>