More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1196 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  100 
 
 		 276 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  100 
 
 		 291 aa  555  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  91.64 
 
 		 281 aa  511  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  67.87 
 
 		 286 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  66.3 
 
 		 275 aa  363  1e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  65.67 
 
 		 276 aa  359  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  65.07 
 
 		 276 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  67.18 
 
 		 276 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  65.78 
 
 		 262 aa  342  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  50.75 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4570  RNA methyltransferase  48.19 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0223529  normal  0.0756262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.8 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.277848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  48.61 
 
 		 279 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  45.38 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  51.45 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  48.4 
 
 		 399 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  50.21 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0394  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.6 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  44.98 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.16 
 
 		 398 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  48.73 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  48.94 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  48.73 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  47.72 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1738  RNA methyltransferase TrmH, group 1  46.18 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1624  RNA methyltransferase TrmH, group 1  45.2 
 
 		 410 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1295  RNA methyltransferase TrmH, group 1  44.4 
 
 		 403 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0420  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.02 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674451  normal  0.0345812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.87 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2243  tRNA/rRNA methyltransferase  45.19 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1403  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.02 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.37 
 
 		 253 aa  185  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2433  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.89 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0788  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.93 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0987211  normal  0.0803398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  42 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.88 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  42.31 
 
 		 243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.62 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  42.62 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  43.04 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.35 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  39.84 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  39.43 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  39.43 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  37.8 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  39.48 
 
 		 240 aa  139  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  39.48 
 
 		 240 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  37.76 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  37.76 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  37.34 
 
 		 241 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.77 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  36.75 
 
 		 240 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  39.06 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  37.34 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  37.02 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  37.34 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.14 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0827  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.05 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  37.77 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.62 
 
 		 247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.36 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  36.75 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  37.34 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  37.34 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.34 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  36.25 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  37.34 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  37.19 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  35 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  34.36 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.63 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.67 
 
 		 241 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  34.73 
 
 		 245 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.69 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.59 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.9 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.69 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.47 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.68 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  37.55 
 
 		 247 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  34.87 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  34.87 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  34.14 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  34.14 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.68 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  37.02 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.15 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  37.3 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.21 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.17 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  35.43 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2187  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.77 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1245  RNA methyltransferase  36.48 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.17 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.17 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  36.17 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.17 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  36.17 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  36.17 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>