More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4570 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4570  RNA methyltransferase  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0223529  normal  0.0756262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.69 
 
 		 398 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1738  RNA methyltransferase TrmH, group 1  55.86 
 
 		 397 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  52.34 
 
 		 410 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  52.34 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.09 
 
 		 271 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.277848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  52.17 
 
 		 399 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1295  RNA methyltransferase TrmH, group 1  53.75 
 
 		 403 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1624  RNA methyltransferase TrmH, group 1  53.36 
 
 		 410 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  50 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0394  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.75 
 
 		 281 aa  228  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  46.18 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  48.19 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  48.19 
 
 		 276 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  43.01 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  42.61 
 
 		 276 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  49.79 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  46.99 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  46.61 
 
 		 276 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  46.72 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  49.79 
 
 		 250 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  45.16 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  45.92 
 
 		 255 aa  209  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  47.83 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2433  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.87 
 
 		 258 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  47.64 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  46.78 
 
 		 243 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.78 
 
 		 243 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  44.64 
 
 		 249 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  47.56 
 
 		 245 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  45.49 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  46.15 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.99 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  45.42 
 
 		 246 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1403  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.26 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0788  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.08 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0987211  normal  0.0803398 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0420  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.62 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674451  normal  0.0345812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.84 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  39.6 
 
 		 275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.24 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2243  tRNA/rRNA methyltransferase  41 
 
 		 251 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  39.48 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  39.57 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  40.69 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  40.69 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  39.5 
 
 		 247 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.73 
 
 		 289 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  40.73 
 
 		 289 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.32 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.92 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.43 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.73 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.55 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0827  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.08 
 
 		 245 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.55 
 
 		 258 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2552  RNA methyltransferase  41.56 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1663  RNA methyltransferase  41.56 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2167  RNA methyltransferase  41.56 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1440  RNA methyltransferase  41.56 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2688  RNA methyltransferase  41.56 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3150  RNA methyltransferase  41.56 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2604  RNA methyltransferase  41.56 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  41.38 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.68 
 
 		 249 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1935  RNA methyltransferase  41.13 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  36.99 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  36 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  36 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  36 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  36 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  36 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0463  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.91 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.74203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  36.91 
 
 		 244 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  39.66 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.18 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  36.03 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  35.02 
 
 		 257 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  35.02 
 
 		 257 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  35.98 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  35.18 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  35.02 
 
 		 257 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  32.48 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  35.08 
 
 		 243 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  31.47 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.1 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  32.78 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1571  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.19 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.6 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  35.74 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  36.1 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  35 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>