More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0828 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  100 
 
 
275 aa  569  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  66.3 
 
 
276 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  66.3 
 
 
291 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  66.42 
 
 
281 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  59.4 
 
 
286 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  59.54 
 
 
276 aa  324  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  56.51 
 
 
276 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  58.78 
 
 
276 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  57.63 
 
 
262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  47.55 
 
 
262 aa  240  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  46.72 
 
 
245 aa  215  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  43.95 
 
 
410 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  47.72 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  46.25 
 
 
245 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  43.95 
 
 
399 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  45.71 
 
 
245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  47.26 
 
 
261 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  47.3 
 
 
250 aa  211  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.62 
 
 
271 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.277848  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.62 
 
 
398 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.49 
 
 
266 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  45.2 
 
 
399 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  43.87 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0420  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41 
 
 
258 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674451  normal  0.0345812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1738  RNA methyltransferase TrmH, group 1  44.22 
 
 
397 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1403  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.16 
 
 
257 aa  191  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0394  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.87 
 
 
281 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.8 
 
 
253 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10914  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1295  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.2 
 
 
403 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4570  RNA methyltransferase  39.6 
 
 
298 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0223529  normal  0.0756262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1624  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.6 
 
 
410 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0788  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.26 
 
 
248 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0987211  normal  0.0803398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2243  tRNA/rRNA methyltransferase  43.4 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.03 
 
 
243 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  41.03 
 
 
243 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.6 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  40.17 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  39.41 
 
 
246 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  38.4 
 
 
255 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2433  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.82 
 
 
258 aa  168  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.17 
 
 
249 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  36.32 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  38.2 
 
 
240 aa  136  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  36.86 
 
 
244 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  36.21 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  38.2 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  35.9 
 
 
251 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  35.78 
 
 
257 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.75 
 
 
246 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  35.1 
 
 
245 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  35.47 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  36.48 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  35.71 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  35.71 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  36.05 
 
 
240 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.77 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.18 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.47 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.63 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0827  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.9 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  36.91 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  34.15 
 
 
251 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  35.78 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.8 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.57 
 
 
248 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.06 
 
 
257 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.75 
 
 
264 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.91 
 
 
289 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.34 
 
 
289 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  33.88 
 
 
257 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  35.34 
 
 
289 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  33.76 
 
 
251 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35 
 
 
241 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  33.47 
 
 
308 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  34.15 
 
 
262 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  35.62 
 
 
273 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.98 
 
 
244 aa  122  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.58 
 
 
241 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.91 
 
 
247 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  35.74 
 
 
273 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.08 
 
 
256 aa  122  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.08 
 
 
256 aa  122  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  34.96 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.58 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.29 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.05 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2062  tRNA/rRNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.71 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  35.34 
 
 
289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  33.88 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  33.07 
 
 
257 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  33.47 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.59 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  34.33 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  33.07 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.72 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.9 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  33.07 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  35.17 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  35.93 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.47 
 
 
249 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>