More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3341 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  100 
 
 		 245 aa  487  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  92.65 
 
 		 245 aa  455  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  91.84 
 
 		 245 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  78.9 
 
 		 261 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  75.95 
 
 		 248 aa  360  9e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  74.69 
 
 		 250 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.51 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.277848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  51.87 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.49 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0394  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.77 
 
 		 281 aa  221  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  50.21 
 
 		 410 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.79 
 
 		 398 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  48.56 
 
 		 399 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  49.79 
 
 		 276 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  47.13 
 
 		 286 aa  215  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  49.37 
 
 		 276 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  50.63 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  49.79 
 
 		 276 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  49.38 
 
 		 399 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  49.79 
 
 		 246 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  46.72 
 
 		 275 aa  206  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  47.72 
 
 		 276 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1738  RNA methyltransferase TrmH, group 1  49.38 
 
 		 397 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  47.72 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  48.76 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  47.33 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.38 
 
 		 253 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  46.38 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4570  RNA methyltransferase  46.15 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0223529  normal  0.0756262 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1295  RNA methyltransferase TrmH, group 1  48.33 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.91 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  46.91 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2243  tRNA/rRNA methyltransferase  47.46 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  44.81 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1624  RNA methyltransferase TrmH, group 1  47.92 
 
 		 410 aa  188  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0788  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.9 
 
 		 248 aa  188  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0987211  normal  0.0803398 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  44.68 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.53 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2433  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.28 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1403  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.22 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0420  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.04 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674451  normal  0.0345812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.87 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.55 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0974  RNA methyltransferase  35.34 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.67 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2746  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.48 
 
 		 256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.504131  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  35.9 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.33 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  35.22 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  36.52 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  35.29 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  36.52 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.5 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  36.32 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  35.5 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  36.32 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  36.52 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  37.02 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  34.58 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  35.11 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.29 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  36.6 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  38.98 
 
 		 257 aa  118  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  33.77 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1219  RNA methyltransferase  35.81 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.8 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.48 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  35.56 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  34.29 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  34.47 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.12 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.48 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0463  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.66 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.74203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.84 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1571  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.62 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0441  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.03 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  35.32 
 
 		 308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  32.8 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04244  hypothetical protein  40.4 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04279  predicted rRNA methyltransferase  40.4 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5917  putative RNA methyltransferase  40.4 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.579463  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3595  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.74 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1155  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.49 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  32.4 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.45 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.04 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.86 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5002  putative RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.985383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0571  putative RNA methyltransferase  38.41 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.918985  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4639  putative RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0771017  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0673  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.02 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000736147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3654  putative RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.749587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  34.63 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  30.42 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0563  putative RNA methyltransferase  37.75 
 
 		 228 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  33.91 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>