More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1365 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2117  RNA methyltransferase TrmH, group 1  44.59 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  32.65 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  32.17 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.64 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.78 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  39.88 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.65 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  30.09 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.04 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2949  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.91 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.13 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.84 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  36.65 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  38.36 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0788  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.56 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0987211  normal  0.0803398 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  37.18 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2433  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.42 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.32 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.52 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.1 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  40.13 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 252 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  31.06 
 
 		 276 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  34.9 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4570  RNA methyltransferase  34.21 
 
 		 298 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0223529  normal  0.0756262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.55 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  31.11 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  35 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.2 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  38.22 
 
 		 276 aa  101  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  35.85 
 
 		 243 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  38.22 
 
 		 291 aa  101  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  36.77 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  31.74 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  31.74 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  36.6 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.85 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2243  tRNA/rRNA methyltransferase  37.5 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.6 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2517  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.91 
 
 		 353 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  hitchhiker  0.00000580733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  36.6 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  35.85 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  37.09 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.19 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1620  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.91 
 
 		 278 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.96 
 
 		 399 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  36.6 
 
 		 241 aa  98.6  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  36.18 
 
 		 254 aa  98.6  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  35.03 
 
 		 254 aa  98.6  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  33.86 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  33.01 
 
 		 241 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.99 
 
 		 264 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  35.53 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  36.08 
 
 		 262 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.82 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  36.6 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.84 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  33.01 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  33.01 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  37.72 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  36.42 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  37.82 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.14 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.81 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11611  tRNA/rRNA methyltransferase  33.16 
 
 		 250 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.14 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4923  putative RNA methyltransferase  35.88 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000405999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  29.91 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.94 
 
 		 276 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.31 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  30.17 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  29.29 
 
 		 257 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  27.35 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  29.31 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11621  tRNA/rRNA methyltransferase  34.39 
 
 		 250 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5013  putative RNA methyltransferase  35.88 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  36.13 
 
 		 263 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3085  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.18 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  36.13 
 
 		 263 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04279  predicted rRNA methyltransferase  37.28 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3595  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.72 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04244  hypothetical protein  37.28 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  35.9 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.31 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  33.11 
 
 		 273 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5009  putative RNA methyltransferase  35.88 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4957  putative RNA methyltransferase  35.29 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.914631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.95 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3654  putative RNA methyltransferase  37.28 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.749587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2604  RNA methyltransferase  36.18 
 
 		 311 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5002  putative RNA methyltransferase  37.28 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.985383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4639  putative RNA methyltransferase  37.28 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.18 
 
 		 271 aa  95.5  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.277848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  29.71 
 
 		 308 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5917  putative RNA methyltransferase  34.85 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.579463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>