274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4957 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4957  putative RNA methyltransferase  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.914631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5013  putative RNA methyltransferase  98.68 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4923  putative RNA methyltransferase  98.68 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000405999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5009  putative RNA methyltransferase  98.68 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4850  putative RNA methyltransferase  99.51 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0238546  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04279  predicted rRNA methyltransferase  82.89 
 
 		 228 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3595  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  82.89 
 
 		 228 aa  390  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4639  putative RNA methyltransferase  82.46 
 
 		 228 aa  390  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5002  putative RNA methyltransferase  82.46 
 
 		 228 aa  390  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.985383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5917  putative RNA methyltransferase  82.89 
 
 		 228 aa  390  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.579463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3654  putative RNA methyltransferase  82.46 
 
 		 228 aa  390  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.749587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  82.46 
 
 		 228 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04244  hypothetical protein  83.48 
 
 		 229 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  82.02 
 
 		 228 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0563  putative RNA methyltransferase  74.56 
 
 		 228 aa  356  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  73.25 
 
 		 228 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0532  putative RNA methyltransferase  71.81 
 
 		 233 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0571  putative RNA methyltransferase  69.16 
 
 		 232 aa  332  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.918985  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  71.49 
 
 		 228 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  69.3 
 
 		 228 aa  327  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3658  putative RNA methyltransferase  46.9 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1753  putative RNA methyltransferase  48.23 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005917  hitchhiker  0.00815274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  33.18 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  44.16 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  34.08 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.71 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.39 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  34.25 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.89 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.03 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.03 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.75 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  40.25 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  37.09 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  38.1 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.67 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  35.36 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  29.53 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  39.35 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  33.68 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  40 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  34.86 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  39.07 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  35.08 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.31 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  35.26 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  37.66 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.89 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.42 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.94 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  36.65 
 
 		 291 aa  99.4  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  36.65 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.43 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.56 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  31.96 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.68 
 
 		 276 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  35.33 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  37.42 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.33 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  31.88 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.16 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  39.1 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  37.25 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  34.73 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  34.38 
 
 		 399 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  34.19 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1243  RNA methyltransferase  31.13 
 
 		 286 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108942  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.62 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.03 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  34.41 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0275  RNA methyltransferase  38.71 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00988641  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.86 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.29 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  35.76 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  36.6 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2281  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.87 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  34.64 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.31 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0394  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33 
 
 		 281 aa  95.1  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.61 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.31 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  34.09 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2949  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.22 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  33.75 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1129  RNA methyltransferase  40 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  35.53 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  35.44 
 
 		 267 aa  94.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.2 
 
 		 259 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  33.75 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  34.09 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.75 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  30.08 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.71 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  35.53 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  33.75 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3229  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.88 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  37.01 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  34.18 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  30.43 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>