293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0682 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0563  putative RNA methyltransferase  71.49 
 
 		 228 aa  351  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0532  putative RNA methyltransferase  74.89 
 
 		 233 aa  350  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0571  putative RNA methyltransferase  73.13 
 
 		 232 aa  347  9e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.918985  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  74.12 
 
 		 228 aa  344  6e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  74.12 
 
 		 228 aa  343  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3595  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  69.74 
 
 		 228 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  69.3 
 
 		 228 aa  334  7.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04279  predicted rRNA methyltransferase  68.86 
 
 		 228 aa  333  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5917  putative RNA methyltransferase  69.3 
 
 		 228 aa  333  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.579463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5002  putative RNA methyltransferase  68.86 
 
 		 228 aa  332  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.985383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  68.86 
 
 		 228 aa  332  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4639  putative RNA methyltransferase  68.86 
 
 		 228 aa  332  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3654  putative RNA methyltransferase  68.86 
 
 		 228 aa  332  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.749587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04244  hypothetical protein  69.2 
 
 		 229 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4923  putative RNA methyltransferase  69.74 
 
 		 228 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000405999  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4957  putative RNA methyltransferase  69.3 
 
 		 228 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.914631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5013  putative RNA methyltransferase  69.3 
 
 		 228 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5009  putative RNA methyltransferase  69.3 
 
 		 228 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4850  putative RNA methyltransferase  68.47 
 
 		 203 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0238546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3658  putative RNA methyltransferase  48.23 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1753  putative RNA methyltransferase  47.81 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005917  hitchhiker  0.00815274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  43.87 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  34.21 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  34.63 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  43.14 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  35.21 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  40.65 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  39.87 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.79 
 
 		 231 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  40.88 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  37.95 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  37.95 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  39.61 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  37.95 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  37.35 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.07 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  39.22 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  40 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  36.26 
 
 		 286 aa  111  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.26 
 
 		 264 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 261 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  37.65 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.68 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2281  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  44.81 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.52 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  40.26 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  32.08 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.91 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  39.41 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  31.9 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  37.91 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  38.82 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.26 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.14 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2517  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  44.16 
 
 		 353 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  hitchhiker  0.00000580733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  34.91 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  38.56 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  35 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.65 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  35.29 
 
 		 245 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2949  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.78 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1620  RNA methyltransferase TrmH, group 1  45.16 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  31.65 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.04 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  31.06 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.19 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  39.35 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  37.25 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  38.71 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  39.38 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.18 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  39.07 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.25 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  37.25 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  37.25 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  42.05 
 
 		 289 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  42.05 
 
 		 289 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  38.31 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.13 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  39.07 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.09 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  38.31 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  38.06 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.08 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  38.96 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.08 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  41.57 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  39.61 
 
 		 262 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.87 
 
 		 253 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  38.96 
 
 		 308 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  38.96 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  38.12 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.89 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.26 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  39.1 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  40.91 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>