272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3658 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3658  putative RNA methyltransferase  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04279  predicted rRNA methyltransferase  45.13 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  48.23 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  45.13 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3595  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  45.13 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  44.69 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04244  hypothetical protein  45.54 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4639  putative RNA methyltransferase  44.69 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3654  putative RNA methyltransferase  44.69 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.749587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5002  putative RNA methyltransferase  44.69 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.985383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5917  putative RNA methyltransferase  45.13 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.579463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0532  putative RNA methyltransferase  46.9 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0571  putative RNA methyltransferase  45.58 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.918985  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  46.02 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  46.02 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4957  putative RNA methyltransferase  46.9 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.914631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4923  putative RNA methyltransferase  46.02 
 
 		 228 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000405999  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0563  putative RNA methyltransferase  43.36 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5013  putative RNA methyltransferase  46.46 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5009  putative RNA methyltransferase  45.58 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4850  putative RNA methyltransferase  45.27 
 
 		 203 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0238546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1753  putative RNA methyltransferase  41.52 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005917  hitchhiker  0.00815274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.31 
 
 		 248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  33.8 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  40 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.22 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.34 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  39.34 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  41.56 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  39.13 
 
 		 244 aa  101  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.36 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  34.55 
 
 		 291 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  34.55 
 
 		 276 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  34.41 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.54 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  36.82 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  35.15 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  32.22 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.45 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.67 
 
 		 289 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2552  RNA methyltransferase  39.78 
 
 		 303 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1663  RNA methyltransferase  39.78 
 
 		 306 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  30.64 
 
 		 243 aa  98.2  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2604  RNA methyltransferase  39.89 
 
 		 311 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  32.02 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2688  RNA methyltransferase  39.78 
 
 		 346 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.03 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.03 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1935  RNA methyltransferase  39.23 
 
 		 338 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3150  RNA methyltransferase  39.78 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  41.56 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  41.56 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1440  RNA methyltransferase  39.78 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2167  RNA methyltransferase  39.78 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1620  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.67 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  39.87 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  39.87 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2517  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.56 
 
 		 353 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  hitchhiker  0.00000580733 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  42.04 
 
 		 249 aa  96.3  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  36.18 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  35.26 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  40.38 
 
 		 273 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.62 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  34.62 
 
 		 245 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0853  RNA methyltransferase  38.89 
 
 		 250 aa  94.7  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1161  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  40.51 
 
 		 287 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  0.325888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.42 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  38.04 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  34.21 
 
 		 286 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  41.03 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  35.57 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2062  tRNA/rRNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.5 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0985  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.25 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.223489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  34.36 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  38.67 
 
 		 289 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 260 aa  92  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.9 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2746  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.56 
 
 		 256 aa  91.7  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.504131  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  38.2 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0941  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.51 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0827  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.68 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  35.71 
 
 		 263 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.46 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.76 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.8 
 
 		 399 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  35.71 
 
 		 263 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.48 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.88 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.29 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0441  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.54 
 
 		 276 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.2 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.91 
 
 		 258 aa  88.6  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.16 
 
 		 264 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1096  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.51 
 
 		 294 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.18 
 
 		 276 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  36.69 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.09 
 
 		 246 aa  87.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.33 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>