267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0768 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  68.56 
 
 		 261 aa  333  9e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  65.79 
 
 		 251 aa  332  4e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  64.66 
 
 		 249 aa  329  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  62.61 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  47.58 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  43.42 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  40.25 
 
 		 243 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.06 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.66 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.25 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.54 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.53 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  36.84 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.53 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  34.35 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  33.91 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  32.89 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  33.91 
 
 		 254 aa  121  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.19 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  35.47 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  36.44 
 
 		 245 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.13 
 
 		 248 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.61 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.98 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.2 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.78 
 
 		 262 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  34.43 
 
 		 245 aa  111  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.41 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.02 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  34.62 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.41 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  33.61 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.31 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.47 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  30.89 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  30.24 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.67 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.33 
 
 		 276 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  29.44 
 
 		 241 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0571  putative RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.918985  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  30.49 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  29.44 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  30.24 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  29.44 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.77 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  32.77 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.79 
 
 		 245 aa  101  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  31.43 
 
 		 252 aa  101  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  30.08 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  32.65 
 
 		 262 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  32.38 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  32.63 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  30.23 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  33.87 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  34.45 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  30.58 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.33 
 
 		 276 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.82 
 
 		 264 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.74 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  33.76 
 
 		 273 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.77 
 
 		 289 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1245  RNA methyltransferase  34.43 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  31.9 
 
 		 247 aa  98.6  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  33.05 
 
 		 261 aa  98.6  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  30.77 
 
 		 254 aa  98.6  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  32.07 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 273 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  31.97 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  30.99 
 
 		 242 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.9 
 
 		 399 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.99 
 
 		 242 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  31.71 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  32.64 
 
 		 248 aa  96.3  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  30.99 
 
 		 242 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.31 
 
 		 398 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  30.99 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  30.99 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  32.2 
 
 		 276 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  32.38 
 
 		 257 aa  95.1  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.18 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.18 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  32.38 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  32.24 
 
 		 289 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.89 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.89 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  33.62 
 
 		 399 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.2 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  30.2 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2187  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.43 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  30.17 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>