266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0861 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  100 
 
 		 261 aa  544  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  68.56 
 
 		 232 aa  333  1e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  65.07 
 
 		 249 aa  330  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  66.52 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  63.9 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  48.21 
 
 		 243 aa  224  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  44.93 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  43.35 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.57 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.52 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.87 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.56 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.48 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.44 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  36.64 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  35.65 
 
 		 231 aa  135  8e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  37.39 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  37.83 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  37.39 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  36.71 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.48 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.05 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.02 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.02 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  33.61 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  34.44 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  32.52 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  32.79 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  34.18 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.9 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.03 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.76 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.27 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  33.47 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.04 
 
 		 410 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.75 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  32.81 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  31.69 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  28.68 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  32.51 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  30.25 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.93 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0532  putative RNA methyltransferase  34.78 
 
 		 233 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  31.25 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  33.89 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2187  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.74 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  34.44 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  33.88 
 
 		 245 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  29.83 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  29.83 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  32.33 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  34.15 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  30.64 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.67 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  28.8 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.36 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  30.29 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.36 
 
 		 243 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  33.74 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  33.74 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  31.05 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  29.76 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  31.67 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  32.03 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  29.73 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  31.9 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  31.02 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.02 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  31.02 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.56 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  29.57 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.28 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  31.03 
 
 		 286 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  30.08 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1245  RNA methyltransferase  34.13 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  32.39 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  32.17 
 
 		 399 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.5 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.47 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  31.33 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.47 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.47 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.33 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 245 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.11 
 
 		 245 aa  96.3  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.33 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.33 
 
 		 245 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>